Commencez le processus d'identification des bactéries inconnues en observant leurs caractéristiques physiques, telles que la paroi cellulaire, la forme et les liaisons. Utilisez des procédures de laboratoire standard, comme la coloration cellulaire, la culture et le séquençage de l'ADN pour affiner votre identification. Les bactéries sont généralement regroupées en espèces en fonction de leurs caractéristiques physiques et métaboliques, plutôt que de leurs relations génétiques les unes avec les autres.
Les bactéries positives ou négatives sont des bactéries dites vraies. Ils sont distincts des archaea ou des archaebactéries, qui forment un royaume séparé. Les eubactéries sont des procaryotes, ce qui signifie qu'elles n'ont pas de membrane nucléaire. La plupart ont des membranes cellulaires et des parois cellulaires. Les bactéries avec des parois de cellules épaisses sont appelées gram-positives parce qu'elles sont susceptibles de mourir au cours d'un test appelé coloration de Gram. La coloration de Gram est le premier test utilisé dans la classification bactérienne. Les bactéries dont les parois cellulaires sont minces ou absentes sont gram-négatives parce qu'elles ne piègent pas le colorant de coloration de Gram.
Les bactéries sphériques sont appelées cocci, les bactéries qui forment des bâtonnets droits s'appellent bacilles et les bactéries ayant une forme intermédiaire sont appelées coccobacilles. Ceux-ci peuvent tous être Gram négatif ou Gram positif. Les bactéries rigides en forme de spirale sont connues sous le nom de spirilla et ne sont que gram-négatives. Les bactéries flexibles, indépendamment mobiles, en forme de spirale sont appelées spirochètes et sont gram-neutres. Enfin, les tiges rigides en forme de virgule sont appelées vibrions et sont gram-négatives. Quelques bactéries peu connues et mal comprises ont des formes différentes, comme la stella en forme d'étoile et les labrys en forme de hache. Il y a aussi deux groupes bactériens intermédiaires. Rickettsia sont similaires aux virus, ont une variété de formes, sont Gram négatif et ne peuvent survivre à l'intérieur d'autres cellules. Les mycoplasmes, qui ressemblent aux champignons, manquent de parois cellulaires et comprennent de nombreux pathogènes pulmonaires spécifiques à la pneumonie.
Cubes, grappes et autres liens
Les cocci et les bacilles sont en outre classés par les liaisons qu'ils forment après la division cellulaire. Diplocoques et diplobacilles collent ensemble par paires. Les streptocoques et les streptobacilles forment des chaînes. Les cocci Tetrad restent dans les carrés de quatre bactéries. Les cocci de Sarcinae forment des cubes de huit bactéries et des grappes de staphylocoques.
Identifier la bactérie
Si vous avez une bactérie inconnue et que vous voulez l'identifier, vous effectuerez généralement une coloration de Gram puis observer l'apparence de la colonie et les caractéristiques individuelles. À ce stade, vous pouvez dire que vous avez, par exemple, un streptobacillus aérobie Gram négatif. Vous pouvez ensuite comparer votre échantillon à diverses bactéries connues en le plaçant sur différents milieux de culture qui favorisent la croissance de certaines espèces et en inhibent d'autres, ou en testant l'échantillon pour différents sous-produits bactériens connus. En dernier recours, le séquençage de l'ADN peut déterminer si vous avez une espèce ou une souche bactérienne connue ou inconnue, à condition de la comparer à une espèce ou une souche dont le génome a déjà été séquencé.
