Une équipe de chercheurs de l'Université de Californie a trouvé un moyen de synthétiser plusieurs gènes à partir d'un groupe d'oligonucléotides générés par microarray. Dans leur article publié dans la revue Science , le groupe décrit sa technique, appelé DropSynth, à quel point ça marche, et ses inconvénients.

La synthèse de gènes est devenue si populaire qu'il y a maintenant des entreprises qui le font pour gagner leur vie, mais cela reste une proposition coûteuse - les méthodes actuelles nécessitent de coudre de petits brins en séquences un à la fois après leur création. Dans ce nouvel effort, les chercheurs rapportent une approche unique de la synthèse des gènes qui pourrait conduire à une réduction des coûts.

Actuellement, la synthèse des gènes se fait à l'aide d'un microarray, produire des oligonucléotides d'ADN, qui doivent ensuite être cousus ensemble - l'équipe de l'UoC a également commencé avec un microarray, mais ils ont d'abord donné aux oligonucléotides une longueur d'identification de séquence de gènes, qu'ils décrivent comme un "code à barres". Prochain, ils ont ajouté des microbilles avec des codes-barres complémentaires qui pourraient extraire les oligonucléotides correspondants d'un pool de différents types d'oligonucléotides. Le résultat était un pool de microbilles, dont chacun avait un petit groupe d'oligonucléotides du même type attachés. L'équipe a ensuite enfermé chacune des microbilles (et son groupe d'oligonucléotides) dans une gouttelette d'émulsion en utilisant ce qu'ils décrivent comme un vortex de mélange d'oligonucléotides et d'huile, pendant 30 secondes. Après ça, les enzymes ont induit la fusion de tous les oligonucléotides d'une seule gouttelette (via l'assemblage du cycle de la polymérase), résultant en une séquence souhaitée. Les séquences ont ensuite été retirées de l'émulsion prêtes à l'emploi.

Le processus est meilleur que les méthodes conventionnelles, l'équipe suggère, parce qu'il offre l'accès à un pool de gènes essentiellement au même coût qu'un pool d'oligonucléotides, cela n'ajoute pas grand-chose. Malheureusement, il y a un gros inconvénient. Le processus, ils notent, est "désordonné, " parce qu'il n'est efficace qu'à environ 5 %, ce qui est loin d'être suffisant pour être utilisé dans les processus de fabrication. Sur une note plus positive, la méthode pourrait être utilisée pour créer de grandes bibliothèques de gènes à diverses fins, à très peu de frais. Il pourrait également être utilisé dans les efforts de recherche, en particulier ceux impliqués dans la conception des protéines.

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