Un diagramme de la protéine H-NS. Selon l'environnement, la protéine peut être sous une forme « ouverte » ou « fermée », activer ou désactiver les gènes. Crédit :Université de Leyde
La bactérie intestinale E. coli peut s'adapter aux changements de son environnement. Les scientifiques de Leiden ont découvert comment la protéine H-NS rend cela possible. Ces nouvelles connaissances peuvent être un point de départ important dans la lutte contre les bactéries et les maladies telles que la péritonite. Publication le 2 octobre dans la revue eLife.
E.coli est responsable de toutes sortes de maladies, y compris la péritonite, et est également l'une des causes d'intoxication alimentaire. Cette bactérie contient la protéine H-NS, qui peut activer et désactiver les gènes de la bactérie. L'activation et la désactivation de ces gènes permettent à la bactérie de survivre aux changements de son environnement, comme une hausse ou une baisse de la température. Ramon van der Valk de l'Institut de chimie de Leiden a découvert comment fonctionne exactement ce processus. Ces connaissances pourraient servir de base au développement de nouveaux antibiotiques pour lutter contre la bactérie E. coli (et d'autres).
H-NS détecte lui-même les changements dans l'environnement
"Dès qu'en 2000, mon collègue Remus Dame a découvert comment la protéine H-NS désactive certains gènes de la bactérie E. coli, " expliqua Van der Valk. «Mais nous ne savions pas comment ces gènes pouvaient être réactivés. Il apparaît maintenant que H-NS reçoit des signaux de l'environnement s'il y a un changement dans l'environnement de la bactérie, et en réaction à cela, les gènes sont réactivés. Grâce au travail de Van der Valk et de ses collègues, ce processus a maintenant été tracé. H-NS lui-même semble être capable de détecter les changements, y compris les changements de température et de teneur en sodium.
L'étude était un partenariat entre les universités de Leiden, Amsterdam, et Heidelberg (D), où les chercheurs ont appliqué une approche multidisciplinaire pour examiner le fonctionnement du H-NS et ses effets sur l'environnement. «L'étude s'est concentrée sur différents signaux de l'environnement auxquels la protéine a réagi, comme la température, pH ou changements dans la concentration en sel. En utilisant des méthodes biochimiques et biophysiques en combinaison avec des simulations informatiques, nous avons pu analyser l'effet de ces symboles sur H-NS. Dans un tube à essai, nous avons alors pu influencer la manière dont N-NS se lie à l'ADN.'
Les découvertes de Van der Valk et de ses collègues ont été publiées dans la revue eLife .