Des simulations de dynamique moléculaire révèlent le chaos dans le transport des électrons
Professeur Siewert-Jan Marrink. Crédit :Université de Groningue
Les plantes sont très efficaces pour transformer les photons en électrons. Mais le transport de ces électrons est un processus chaotique, Des scientifiques de l'Université de Groningue ont découvert. Ils ont utilisé la dynamique moléculaire pour visualiser le fonctionnement du photosystème II et ont publié leurs résultats le 10 mai dans Communication Nature .
Les plantes et certaines bactéries utilisent le complexe photosystème II (PSII) pour convertir les photons en électrons libres, qui sont emportés par la molécule plastoquinone à l'étape suivante de la chaîne. Après plusieurs étapes, ces électrons sont utilisés pour produire le vecteur énergétique universel des cellules, ATP. Mais ce qui était inconnu, c'est comment la plastoquinone entre et sort du complexe PSII pour accomplir sa tâche vitale.
Bloc solide
« La structure du PSII était déjà connue. Sur la base de cette structure statique, il a été déduit qu'il existe deux canaux par lesquels la plastoquinone entre et sort, " explique Siewert-Jan Marrink, professeur de dynamique moléculaire à l'Université de Groningue. "Mais il s'avère que ce n'est pas si simple." Marrink, son doctorat L'étudiant Floris van Eerden et ses collègues ont utilisé la dynamique moléculaire pour étudier l'interaction du PSII et de la plastoquinone. Il s'agissait de modéliser l'immense complexe PSII, qui se compose de plusieurs protéines et autres molécules associées dans un immense cluster informatique et calculant les interactions des différentes parties.