* Manque de soleil : La lumière du soleil est essentielle à la photosynthèse. Plus on s’enfonce dans l’océan, moins la lumière du soleil pénètre. Dans les profondeurs marines, il n’y a pratiquement pas de lumière solaire, ce qui rend la photosynthèse impossible.
* Disponibilité limitée en nutriments : La photosynthèse nécessite des nutriments comme les nitrates, les phosphates et le calcium. Bien que ces nutriments soient présents dans les eaux de surface, ils sont souvent rares dans les eaux profondes en raison du manque de productivité due à la lumière solaire.
* Haute pression : L’immense pression exercée dans les profondeurs marines peut endommager les cellules des organismes photosynthétiques, rendant ainsi leur survie difficile.
Au lieu de dépendre de la photosynthèse, les écosystèmes des grands fonds dépendent d'une source d'énergie différente :la chimiosynthèse. . Ce processus utilise l’énergie chimique des sources hydrothermales, des suintements froids ou des hydrates de méthane pour produire de la matière organique, soutenant une gamme diversifiée de formes de vie.
Bien qu’il existe quelques exceptions, comme les coraux des grands fonds qui peuvent bénéficier d’un faible ensoleillement, la grande majorité des écosystèmes des grands fonds dépendent de la chimiosynthèse pour leur survie.