Dans le but de contribuer à un système de surveillance ou d'alerte précoce de la propagation d'une pandémie dans une région donnée, une équipe de recherche suédoise aurait optimisé une méthode de concentration des particules du SRAS-CoV-2 dans les systèmes d'égouts municipaux.

Après comparaison avec d'autres techniques standard, les chercheurs ont conclu que la méthode optimisée, qui a été développé au KTH Royal Institute of Technology, relève deux défis dans la mesure des niveaux de coronavirus dans les eaux usées :que des différences substantielles sont trouvées dans les eaux usées collectées dans diverses parties du monde, et que les particules virales deviennent très diluées dans les eaux usées.

Les chercheurs ont également signalé qu'en appliquant la méthodologie, leurs mesures du coronavirus dans les eaux usées de Stockholm au cours des cinq derniers mois ont été cohérentes avec les données d'infection recueillies par les autorités de santé publique grâce à des tests individuels.

L'épidémiologie basée sur les eaux usées peut être une alternative rentable au test de grandes populations pour le virus SARS-CoV-2, et il a le potentiel d'être utilisé comme système d'alerte précoce pour la propagation de la pandémie, dit Hakim Jafferali, chercheur au Laboratoire Science for Life du KTH (SciLifeLab). "Donc, un système de détection fiable nécessite une méthode validée - et un virus de référence approprié - afin que le virus SARS-CoV-2 concentré soit prêt pour un traitement et une analyse ultérieurs, " il dit.

La technique publiée dans Science de l'environnement total est une modification d'une méthode d'ultrafiltration existante. Plusieurs des méthodes standard de concentration du virus dans les eaux usées ont été comparées, en utilisant des échantillons d'eaux usées de Suède et d'Italie du Nord. Aux fins d'évaluation, les chercheurs ont ajouté un coronavirus bovin à pointes similaires du même genre que le SRAS-CoV-2, comme référence externe. Virus de la marbrure douce du poivre (PMMV), qui est un indicateur de contamination fécale dans les systèmes d'assainissement, s'est avéré être un virus de référence interne fiable.

Jafferali dit qu'une technique basée sur l'ultrafiltration s'est toujours avérée la plus sensible avec des changements tels que le doublement du nombre de fois que les échantillons sont centrifugés. La méthode est couplée à la technique de laboratoire du temps réel, réaction qualitative en chaîne par polymérase (qPCR), qui surveille l'amplification d'une molécule d'ADN ciblée lors de la PCR, pas à sa fin, comme en PCR classique. La recherche a été effectuée au KTH et au SciLifeLab.