La concentration d'entérocoques, bactéries qui se développent dans les matières fécales, a longtemps été la norme fédérale pour déterminer la qualité de l'eau. Les chercheurs ont maintenant montré que les plus grandes influences sur cette concentration sont la quantité d'excréments de mammifères dans l'eau, et le nombre d'entérocoques qui se diffusent sur les particules flottantes. La recherche est publiée vendredi, 13 juillet à Microbiologie appliquée et environnementale , un journal de l'American Society for Microbiology.

"Nous avons également constaté que les caractéristiques spécifiques de l'écosystème, tels que les sédiments d'eau douce et le transport d'eau douce vers l'estuaire sont des influences importantes sur les concentrations d'entérocoques dans les eaux côtières récréatives et de récolte de mollusques, " a déclaré Stephen Jones, doctorat Le Dr Jones est professeur agrégé de recherche, Université du New Hampshire, et directeur associé, Programme de subventions de la mer du New Hampshire.

Les eaux récréatives peuvent abriter un éventail de différents agents pathogènes bactériens, les enquêteurs ont noté dans leur article. La pollution fécale humaine est la plus grande préoccupation pour la santé publique, car il n'y a pas de barrière interspécifique à la transmission à l'homme. "Mais d'autres sources fécales qui contiennent des entérocoques et éventuellement des agents pathogènes humains peuvent être des sources chroniques ou intermittentes des deux, complexifier la gestion de la qualité de l'eau des plages et les efforts d'assainissement, ", ont écrit les enquêteurs.

Le Dr Jones et son étudiant et coauteur Derek Rothenheber, prélevé des échantillons d'eau chaque semaine à Wells, Maine, durant l'été 2016. En 2014, deux des plages de la ville avaient été signalées pour dépassement intermittent des normes de l'État pour les concentrations d'entérocoques, et des avis avaient parfois été affichés pour avertir le public que les eaux pourraient être malsaines – une mauvaise publicité pour une ville balnéaire. Mais en 2016, la région de Wells Beach satisfaisait aux normes de l'État du Maine.

Outre la plage, les enquêteurs ont échantillonné les affluents d'eau douce du bassin versant côtier, et les eaux marines des plages près de l'exutoire de l'estuaire, dit le Dr Jones. Ils ont également échantillonné des sédiments dans les affluents et dans l'estuaire, et le sol des zones entourant les affluents, pour permettre des analyses moléculaires des communautés microbiennes dans l'eau, sédiments, et les sols des différents écosystèmes. Ils ont également mesuré la température de l'eau, salinité, et l'acidité, ainsi que les conditions météorologiques.

Le Dr Jones et M. Rothenheber ont utilisé la réaction en chaîne par polymérase (PCR) pour identifier les animaux qui étaient les sources de matières fécales, et ils ont utilisé le séquençage de l'ADN métagénomique pour caractériser la composition bactérienne de l'eau, sédiment, et des échantillons de sol des différents écosystèmes, " a déclaré le Dr Jones.

Plusieurs agences de l'État du Maine ont maintenant adopté la méthodologie des chercheurs pour évaluer les zones présentant des problèmes de qualité de l'eau, et les enquêteurs ont partagé leurs découvertes lors de conférences, avec d'autres scientifiques et gestionnaires de ressources, afin de diffuser leurs techniques de surveillance de la qualité de l'eau.

L'Environmental Protection Agency des États-Unis a établi des règlements sur la qualité de l'eau basés sur les entérocoques comme indicateur de la pollution d'origine fécale, pour aider à gérer la qualité de l'eau sur les plages estuariennes et marines.

Le Dr Jones a noté que les entérocoques sont des organismes polyvalents qui se développent non seulement dans le côlon, mais aussi dans le sol et dans les couches sédimentaires des lacs, rivières, et les eaux marines. "Notre étude rassemble les multiples sources fécales, les divers réservoirs environnementaux, et les conditions environnementales changeantes pour évaluer comment ces variables peuvent toutes influencer les concentrations d'entérocoques dans un environnement côtier, " a déclaré le Dr Jones. "Aucune autre étude n'a adopté une approche aussi globale et solide pour aborder la question des facteurs qui influencent les concentrations d'entérocoques dans les eaux côtières."