Tests d'agents pathogènes du sol - essentiels à l'agriculture, mais laborieusement lent et coûteux - sera bientôt fait avec précision, vite, pas cher et sur place, grâce aux recherches que les scientifiques de la Washington State University partagent avec les phytopathologistes.

Comme le nom l'indique, ces tests détectent dans le sol des agents pathogènes pathogènes qui peuvent gravement dévaster les cultures.

Jusqu'à maintenant, les tests ont demandé de gros, des équipements coûteux ou des tests de laboratoire qui prennent des semaines.

Le processus d'analyse des agents pathogènes du sol est basé sur des tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) très spécifiques et sensibles et possibles uniquement en laboratoire.

Les nouvelles méthodes, conçu par les phytopathologistes de WSU, ne sont pas seulement portables et rapides, mais utiliser du matériel de test facilement accessible au public. Un article des chercheurs répertorie tous les équipements et matériaux nécessaires à la construction de l'appareil, ainsi que des instructions sur la façon de tout assembler et d'effectuer des analyses de sol.

Répondre aux besoins des producteurs

« De nombreux producteurs nous ont dit que le temps nécessaire pour obtenir des résultats à partir d'échantillons de sol envoyés à un laboratoire est trop long, " dit Kiwamu Tanaka, professeur adjoint au département de phytopathologie de la WSU. "Les résultats reviennent trop tard pour être utiles. Mais s'ils peuvent obtenir des résultats sur place, ils pouvaient prendre des décisions éclairées sur les traitements ou les changements de gestion avant même de planter leur culture. »

Certaines maladies causées par des agents pathogènes du sol peuvent ne pas être visibles avant des semaines après la germination de la culture, dit Tanaka. Cela pourrait être trop tard pour traiter la maladie ou pourrait obliger les agriculteurs à utiliser davantage de traitements.

Percée magnétique

Joseph DeShields, étudiant diplômé de la WSU, un premier auteur sur le papier, a déclaré qu'il avait fallu environ six mois de travail pour que leur appareil fonctionne sur le terrain. Il s'appuie sur des aimants pour capturer l'ADN des agents pathogènes du sol.

"Il s'avère, il est vraiment difficile de séparer et de purifier le matériel génétique du sol parce que le sol contient tellement de matériel pour les tests PCR, " a déclaré DeShields "Nous étions donc ravis lorsque nous avons fait cette percée."

Rachel Bomberger est un diagnosticien d'usine WSU qui a aidé avec les concepts des tests de la machine. Elle a dit qu'elle était impressionnée par ce que Tanaka et l'équipe ont accompli.

« Nous avons supprimé une énorme pierre d'achoppement en ce qui concerne les analyses de sol, " dit Bomberger, l'un des co-auteurs de l'article. "Nous avons trouvé la pièce manquante qui permet aux systèmes de test de fonctionner sur le terrain sans équipement de laboratoire ni matériel de test coûteux."

Application mondiale

Le système a été testé sur des champs de pommes de terre autour de l'est de Washington, Tanaka a dit, mais il fonctionnera sur le sol n'importe où dans le monde.

"C'est une méthode vraiment polyvalente, " at-il dit. " Vous pouvez l'utiliser pour la cartographie des agents pathogènes à l'échelle nationale ou regarder la distribution des agents pathogènes à travers le pays. Nous avons commencé petit, mais cela pourrait avoir d'énormes implications pour tester la santé et les maladies du sol. »

Tanaka a déclaré qu'il était important que cette découverte soit disponible dans un journal vidéo en libre accès.

« Nous sommes toujours soucieux d'aider chaque producteur et l'industrie dans son ensemble, " a déclaré Tanaka. " Nous voulons que tout le monde regarde cela et l'utilise, s'ils pensent qu'ils en bénéficieront."

Les résultats ont été publiés dans le Journal des expériences visualisées .