Décomposition aérobie se produit en présence d’oxygène. Elle est réalisée par divers micro-organismes, notamment des bactéries, des champignons et des actinomycètes. Ces micro-organismes décomposent la matière organique en composés plus simples, tels que le dioxyde de carbone, l'eau et les nutriments. Le processus de décomposition aérobie produit également de la chaleur et de l’énergie.
Décomposition anaérobie se produit en l’absence d’oxygène. Elle est réalisée par un ensemble différent de micro-organismes, notamment des bactéries et des archées. Ces micro-organismes décomposent la matière organique en composés plus simples, comme le méthane, le dioxyde de carbone et les nutriments. Le processus de décomposition anaérobie ne produit ni chaleur ni énergie.
Les produits de décomposition de la matière organique sont importants pour diverses raisons. Ils fournissent des nutriments aux plantes et à d’autres organismes. Ils contribuent également au recyclage du carbone et d’autres éléments dans l’environnement. De plus, les produits de décomposition de la matière organique peuvent être utilisés comme source d’énergie, par exemple dans la production de biogaz.