Même si l’hydrogène produit à partir du charbon peut être utilisé comme combustible propre, le processus de gazéification du charbon en lui-même n’est pas considéré comme une technologie propre. Les usines de gazéification du charbon émettent des gaz à effet de serre, notamment du dioxyde de carbone et du méthane, ainsi que d'autres polluants tels que le dioxyde de soufre et les oxydes d'azote. De plus, l’extraction du charbon et le transport peuvent également avoir des impacts environnementaux.
Pour atténuer les impacts environnementaux de la gazéification du charbon, des technologies de captage et de stockage du carbone (CSC) peuvent être utilisées pour capturer et stocker le dioxyde de carbone produit au cours du processus. Cependant, les technologies CSC sont encore en développement et ne sont pas encore largement mises en œuvre à l’échelle commerciale.
Dans l’ensemble, même si l’hydrogène produit à partir du charbon peut constituer un combustible propre, le processus de gazéification du charbon en lui-même n’est pas considéré comme une technologie propre. De nouveaux progrès dans les technologies de CSC et les méthodes alternatives de production d’hydrogène sont nécessaires pour faire de l’hydrogène issu du charbon un carburant véritablement propre.