L'électrophorèse sur gel est un moyen de séparer les fragments d'ADN en fonction de leur taille. Vous ajoutez un colorant de suivi à chaque échantillon d'ADN pour vous aider à voir l'échantillon et à suivre la progression des fragments d'ADN à travers le gel.
Signification
Pour séparer des fragments d'ADN, dans le but de En mesurant leur taille ou en isolant un fragment particulier, les scientifiques ont mis de l'ADN dans un gel d'agarose immergé dans une solution chargée d'un courant électrique. Le courant pousse les fragments d'ADN à travers le gel, et parce que le gel est poreux, de plus petits fragments d'ADN se frayent un chemin plus rapidement. Ils voyagent plus loin que les plus gros fragments dans le même laps de temps.
Objet
L'ADN est incolore lorsqu'il est en solution dans un tube à essai. Pour rendre l'échantillon plus facile à voir, à la fois dans le tube à essai et dans le gel, vous ajoutez un colorant de suivi coloré à l'échantillon. Le colorant n'affecte pas du tout l'ADN.
Tracking
Le colorant de suivi habituel est le bleu de bromophénol dans une solution de glycérol à 50%. Le bleu de bromophénol colore l'échantillon en bleu vif afin qu'il soit facile de suivre sa progression à travers le gel. Lorsque le colorant de suivi a parcouru environ 3/4 de la longueur du gel, il est temps de couper le courant électrique.
Densité
Le colorant de suivi est dense en raison de sa concentration élevée de glycérol. Cela fait que les échantillons d'ADN s'enfoncent dans les fentes de chargement du gel, plutôt que de flotter dans la solution au-dessus du gel qui transporte le courant électrique.
Migration du colorant
Le bleu de bromophénol migre à travers un agarose solution à peu près au même taux qu'un brin d'ADN contenant 300 paires de bases. Si vous voulez suivre la progression des plus grands brins d'ADN, vous pouvez utiliser un colorant de suivi avec du xylène cyanol, qui migre à peu près au même rythme qu'un brin d'ADN avec 4000 paires de bases.