Dans l'étude, l'équipe de recherche a purifié le Cdc48 directement à partir de cellules de levure (Saccharomyces cerevisiae) et a pris des instantanés des particules purifiées dans différentes configurations après avoir été congelées instantanément par microscopie électronique cryogénique (cryo-EM).

"Les cellules font déjà le gros du travail pour nous en fabriquant ces complexes, " dit Shen. " Parce que cette méthode est si rapide, nous avons capturé Cdc48 en train de déplier un substrat protéique."

En utilisant cette approche, l'équipe de recherche a démontré comment Cdc48 déplie la protéine en la faisant passer à travers un pore central du complexe, en utilisant un mouvement de type convoyeur main sur main. L'enchevêtrement recyclé qu'ils imaginaient était un mystère jusqu'à ce que des collaborateurs de l'Université Brigham Young appliquent la protéomique par spectrométrie de masse au même complexe récolté pour démasquer le complexe protéinique inactif de la protéine phosphatase 1 anonyme.

Shen pense que ces résultats sont applicables aux cellules humaines, car Cdc48 est hautement conservé.

"Nous pensons que la structure que nous avons résolue ici ressemblera beaucoup à ce que nos corps expriment en ce moment, " il a dit.

L'équipe de recherche n'a pas pu visualiser l'ensemble du complexe car Cdc48 interagit avec plusieurs partenaires de liaison presque simultanément. Ce multitâche efficace brouille la reconstruction; cependant, Shen veut continuer à explorer comment Cdc48 parvient à se lier avec autant de partenaires à peu près en même temps.

« La partie la plus intéressante est que ce [travail] démontre que nous pouvons extraire une protéine directement des cellules hôtes et les imager dans leur état natif, " a déclaré Shen. "Je pense que c'est l'avenir du champ cryo-EM."