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    La plupart des informations sur les protéines jamais capturées à partir d'une seule cellule grâce à la nouvelle technologie nanoPOTS

    La puce contenant plusieurs puits où les protéines des cellules individuelles sont séparées pour une analyse plus approfondie. Crédit :PNNL

    Les scientifiques ont obtenu une multitude d'informations clés sur les protéines, les chevaux de bataille moléculaires de toutes les cellules, à partir de cellules humaines uniques pour la première fois.

    Le stock d'informations sur les protéines - le plus grand nombre de données jamais collectées à partir d'une seule cellule de mammifère - donne aux scientifiques l'un de leurs regards les plus clairs à ce jour sur les événements moléculaires à l'intérieur d'une cellule humaine. De telles données peuvent révéler si une cellule est une cellule cancéreuse voyous, une cellule pancréatique défaillante impliquée dans le diabète, ou un acteur moléculaire important pour la survie d'un prématuré.

    Ces événements et bien d'autres sont déterminés par les actions des protéines dans les cellules. Jusqu'à maintenant, des informations détaillées sur les protéines à l'intérieur des cellules individuelles étaient difficiles à trouver. Les « données brutes - la quantité de chaque protéine - dans une cellule sont extraordinairement rares et difficiles à mesurer. C'est en grande partie parce que les scientifiques ne peuvent pas amplifier les protéines comme ils le peuvent les gènes ou d'autres messagers moléculaires.

    Maintenant, dans une étude publiée dans Angewandte Chemie , scientifiques du Pacific Northwest National Laboratory du ministère de l'Énergie, travailler avec des homologues du centre médical de l'Université de Rochester, montrent comment ils ont pu apprendre une quantité sans précédent d'informations sur les protéines dans des échantillons de cellules pulmonaires humaines uniques.

    Les scientifiques ont analysé des cellules individuelles, d'abord à partir de cellules cultivées puis des poumons d'un donneur humain, et détecté en moyenne plus de 650 protéines dans chaque cellule, bien plus que les techniques conventionnelles de capture à partir de cellules individuelles.

    L'équipe, y compris les chimistes analytiques Ying Zhu et Ryan Kelly et les biochimistes Geremy Clair et Charles Ansong, fait les découvertes grâce à une technologie créée à l'EMSL, le Laboratoire des sciences moléculaires de l'environnement, une installation utilisateur du DOE Office of Science située au PNNL. L'équipe a développé la technologie, appelé nanoPOTS, pour mesurer les protéines dans un minuscule, quantité presque inimaginable de matériel.

    "NanoPOTS est comme un microscope moléculaire qui nous permet d'analyser des échantillons 500 fois plus petits que ce que nous pouvions voir auparavant, " dit Kelly, l'auteur correspondant de l'article. "Nous pouvons identifier plus de protéines dans une cellule que ce qui pouvait être identifié auparavant à partir d'un groupe de centaines de cellules."

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