Il n'y a pas de système universellement convenu de catégoriser les enzymes en seulement trois catégories principales. Cependant, les enzymes sont le plus souvent classées en fonction du type de réaction qu'ils catalysent , ce qui conduit à six classes principales:

1. oxydoréductases: Catalyser les réactions d'oxydation-réduction (transfert d'électrons).

2. transférases: Catalyser le transfert de groupes fonctionnels (par exemple, méthyl, phosphate, groupes amino).

3. Hydrolases: Catalyser l'hydrolyse des liaisons (en utilisant de l'eau).

4. lyases: Catalyser la rupture des liaisons sans hydrolyse ni oxydation, formant souvent une nouvelle double liaison ou anneau.

5. isomérases: Catalyser le réarrangement des atomes dans une molécule, formant des isomères.

6. Ligases: Catalyser la jonction de deux molécules, en utilisant souvent de l'énergie à partir de l'hydrolyse de l'ATP.

Vous pourriez affirmer que ces six classes peuvent être largement regroupées en trois catégories :

* hydrolases: Décomposer des molécules (y compris les odoréductases, qui peuvent être considérées comme un cas spécial d'hydrolyse)

* transférases: Transfert de groupes fonctionnels

* ligases et lyases: Création et modification des molécules (à l'exclusion des isomérases, qui pourraient être considérées comme une sous-catégorie de ce groupe)

Cependant, cette catégorisation est simplifiée et peut ne pas refléter avec précision la complexité de la fonction enzymatique. Il est important de noter que le système à six classes est la méthode de classification la plus couramment utilisée et acceptée.