* Redondance: Les plantes ont souvent plusieurs gènes qui remplissent des fonctions similaires. Si un gène est éliminé, un autre gène pourrait reprendre son rôle, masquant l'effet de la mutation. Ceci est connu sous le nom de redondance génétique.
* Effets conditionnels: La mutation pourrait avoir un effet que dans des conditions environnementales spécifiques (par exemple, stress, carence en nutriments, températures spécifiques). Dans des conditions normales, la plante peut sembler identique au type sauvage.
* phénotypes subtils: La mutation peut provoquer un changement dans un processus physiologique qui n'est pas facilement visible à l'œil nu. Cela pourrait inclure des changements dans le métabolisme, les niveaux d'hormones ou l'expression des gènes.
* knockout incomplet: Le KO pourrait ne pas éliminer complètement la fonction du gène. Il pourrait encore y avoir une certaine activité résiduelle, ou le gène pourrait être partiellement éliminé, conduisant à un effet moins grave.
* Étape de développement: Le phénotype ne peut être visible qu'à un stade de développement spécifique. Par exemple, la mutation peut affecter la germination des graines mais n'a pas d'effet visible sur les plantes adultes.
comment détecter les phénotypes cachés:
Même si un mutant knockout ne montre pas de phénotype visible, il est possible de détecter les changements au niveau moléculaire en utilisant diverses techniques:
* Analyse de l'expression des gènes: Le séquençage de l'ARN ou le qPCR peut être utilisé pour déterminer si l'expression d'autres gènes est modifiée chez le mutant.
* Analyse des protéines: Western blot ou d'autres techniques peuvent être utilisés pour mesurer les niveaux de protéines et leur activité.
* tests biochimiques: Ceux-ci peuvent être utilisés pour mesurer les changements dans les voies métaboliques ou l'activité enzymatique.
* Études physiologiques: L'analyse de la réponse de la plante à des stimuli spécifiques (par exemple, le stress, la lumière, les nutriments) peut révéler des différences subtiles entre le type mutant et le type sauvage.
En conclusion: Bien qu'un mutant knockout puisse sembler identique au type sauvage, cela ne signifie pas qu'il n'y a pas de changements. Des investigations plus approfondies sont souvent nécessaires pour découvrir des phénotypes cachés et comprendre pleinement les conséquences du knock-out gène.
