1. Enregistrement des fossiles: Les fossiles fournissent un enregistrement direct de la vie sur Terre sur des millions d'années. Nous voyons des schémas clairs de changement dans les organismes au fil du temps, avec des formes de vie plus simples apparaissant plus tôt dans le dossier géologique et des formes plus complexes émergeant plus tard. Par exemple, le dossier fossile montre la transition du poisson aux amphibiens, des reptiles aux mammifères et de l'évolution des chevaux, des petits ancêtres à plusieurs pieds aux grands animaux à pointe que nous connaissons aujourd'hui. Cette progression des fossiles fournit des preuves convaincantes que la vie a changé au fil du temps, soutenant l'idée de l'évolution.
2. Structures homologues: Ce sont des structures trouvées dans différentes espèces qui partagent une anatomie sous-jacente commune, malgré des fonctions différentes. Un exemple classique est la structure osseuse des membres antérieurs des vertébrés:les humains, les chats, les chauves-souris et les baleines partagent tous un arrangement osseux similaire dans leurs membres antérieurs, même si ces membres sont utilisés pour des activités très différentes (saisir, marcher, voler, nager). Cette similitude pointe avec un ancêtre commun, indiquant que ces espèces sont issues d'une lignée partagée. La présence de structures homologues soutient fortement l'idée d'une descente commune et d'un changement évolutif.