1. algues vertes (chlorophyta) :Ce sont les plus étroitement liés aux plantes terrestres, contenant de la chlorophylle A et B. Ils peuvent être unicellulaires, coloniaux ou multicellulaires.
2. algues rouges (Rhodophyta) :Ces algues contiennent de la chlorophylle A et de la phycoérythrin, un pigment rouge, qui leur donne leur couleur. La plupart sont multicellulaires et principalement marins.
3. algues brunes (phaeophyta) :Ce groupe contient de la chlorophylle A et C, ainsi que la fucoxanthine, un pigment brun. Ils sont principalement multicellulaires et trouvés dans des eaux fraîches et tempérées.
4. Diatoms (Bacillariophyceae) :Ce sont des algues unicellulaires avec des parois de cellules de silice complexes. Ils sont extrêmement abondants dans les environnements d'eau douce et marine.
5. dinofagellates (dinophyceae) :Ces algues unicellulaires ont deux flagelles et sont souvent responsables des fleurs d'algues nocives. Certains dinoflagellates possèdent également des propriétés bioluminescentes.
Bien qu'il existe d'autres petits groupes d'algues, ces cinq sont les plus importants et diversifiés.