1. Preuve génomique et moléculaire:
* Structure de l'ARN ribosomal (ARNr): Les archées et les eucaryotes partagent une structure d'ARNr plus similaire par rapport aux bactéries. Ce fut l'une des premières preuves suggérant leur relation étroite.
* Synthèse des protéines: Les archées et les eucaryotes utilisent un ensemble similaire de facteurs d'initiation et d'allongement pour la synthèse des protéines, tandis que les bactéries utilisent un ensemble distinct.
* Organisation des gènes: Les archées ont des gènes organisés en opérons comme les bactéries, mais les opérons en archaea sont plus similaires dans ceux trouvés dans les eucaryotes.
* Histones: Bien que les bactéries manquent d'histones, les archées possèdent des protéines de type histone qui aident à organiser leur ADN, une caractéristique similaire aux eucaryotes.
* Structure de la membrane cellulaire: Les archées ont des lipides membranaires uniques qui sont plus similaires aux lipides eucaryotes que les lipides bactériens.
2. Histoire évolutive:
* Analyse phylogénétique: Les arbres phylogénétiques basés sur divers marqueurs moléculaires (ARNr, séquences de protéines) placent systématiquement l'archaea comme le groupe sœur le plus proche des eucaryotes. Cela suggère un ancêtre commun pour les archées et les eucaryotes.
* Transfert de gènes horizontaux: Les preuves suggèrent qu'il y a eu un transfert de gènes horizontal étendu entre les archées et les eucaryotes, en particulier dans les premiers stades de leur évolution.
3. Caractéristiques métaboliques et cellulaires:
* voies métaboliques: Les archées et les eucaryotes partagent certaines voies métaboliques que l'on ne trouve pas dans les bactéries, telles que la capacité de réparer l'azote gazeux.
* Division cellulaire: Le mécanisme de la division cellulaire dans les archées est plus similaire aux eucaryotes qu'aux bactéries.
* Transcription et traduction: Alors que les bactéries utilisent un système plus simple pour ces processus, les archées et les eucaryotes ont des machines plus complexes.
Cependant, il est important de noter que:
* Archaea et Eucaryotes sont des domaines distincts de la vie: Ils ne sont pas simplement «étroitement liés» - ce sont des branches distinctes de l'arbre de vie.
* La relation évolutive entre Archaea et Eucaryotes est complexe: Bien qu'il existe des preuves solides de leur relation étroite, il existe également des différences entre eux. Certains chercheurs pensent que le dernier ancêtre commun d'Archaea et d'Eucaryotes était probablement plus complexe qu'on ne le pensait auparavant.
La compréhension actuelle est que les archées et les eucaryotes partagent un ancêtre commun qui divergeait de la lignée conduisant à des bactéries. Cela rend les archées plus étroitement liées aux eucaryotes qu'aux bactéries. Cependant, la nature spécifique de cette relation et les événements évolutifs conduisant à la diversification de ces domaines sont toujours activement étudiés.
