Les groupes fonctionnels toujours trouvés dans les acides aminés sont:

* groupe amino (-nh2) :C'est de là que vient le "Amino" dans l'acide aminé.

* groupe d'acide carboxylique (-cooh) :C'est ce qui donne aux acides aminés leurs propriétés acides.

Ces deux groupes définissent un acide aminé. La chaîne latérale, ou groupe R, est ce qui varie entre les différents acides aminés, leur donnant leurs propriétés uniques.