1. Lyse cellulaire :Les détergents liquides sont des molécules amphipathiques, ce qui signifie qu'ils possèdent à la fois des régions hydrophiles (qui aiment l'eau) et hydrophobes (qui détestent l'eau). Les régions hydrophobes des molécules de détergent interagissent avec et perturbent la bicouche lipidique de la membrane cellulaire, provoquant sa dissolution et sa rupture. Cela conduit à la lyse, ou à la rupture, des cellules et à la libération de leur contenu intracellulaire dans le tampon d'extraction environnant.
2. Solubilisation des composants cellulaires :Après la lyse cellulaire, les composants intracellulaires, notamment les protéines, les lipides et les acides nucléiques, sont libérés dans le tampon d'extraction. Cependant, ces composants peuvent rester associés les uns aux autres, formant des complexes ou des agrégats pouvant entraver une extraction efficace de l’ADN. Le détergent liquide contribue à solubiliser ces complexes en perturbant les interactions entre les différentes molécules et en favorisant leur dispersion dans tout le tampon. Cette étape de solubilisation est cruciale pour garantir la libération et l’accessibilité efficaces de l’ADN génomique.
3. Dénaturation des protéines :En plus de lyser les cellules et de solubiliser les composants cellulaires, le détergent liquide contribue également à la dénaturation des protéines lors de l'extraction de l'ADN. Les protéines peuvent se lier et interagir avec l’ADN, interférant potentiellement avec son isolement. Le détergent perturbe ces interactions protéine-ADN et déplie les structures protéiques, garantissant ainsi que l'ADN génomique reste libre en solution et accessible pour les étapes de purification ultérieures.
4. Inhibition des désoxyribonucléases (DNases) :Certains détergents liquides, tels que le SDS, possèdent une propriété supplémentaire d'inhiber l'activité des désoxyribonucléases (DNases), qui sont des enzymes capables de dégrader l'ADN. Cet effet inhibiteur permet de préserver l’intégrité de l’ADN génomique extrait en empêchant sa dégradation lors du processus d’extraction.
Il convient de noter que le détergent liquide spécifique utilisé dans l’extraction de l’ADN génomique peut varier en fonction de la méthode d’extraction et des préférences de chaque chercheur. Bien que le SDS et le Triton X-100 soient couramment utilisés, d'autres détergents doux ayant des propriétés similaires peuvent également être utilisés à cette fin.
