Lors de la transcription, le brin matrice d'ADN sert de guide pour la synthèse de l'ARN messager (ARNm) par appariement de bases complémentaires avec des ribonucléotides. Au cours de ce processus, des bases azotées spécifiques sur le brin d'ADN s'associent à leurs bases complémentaires sur les ribonucléotides entrants. Voici les règles d’appariement de bases lors de la transcription :

- Adénine (A) sur le brin matrice d'ADN s'associe à Uracile (U) sur le brin d'ARN.

- Thymine (T) sur le brin matrice d'ADN reste non apparié, car il n'y a pas de base correspondante dans l'ARN.

- Cytosine (C) sur le brin matrice d'ADN s'associe à la Guanine (G) sur le brin d'ARN.

- Guanine (G) sur le brin matrice d'ADN s'associe à la Cytosine (C) sur le brin d'ARN.

Pendant la transcription, une enzyme ARN polymérase lit le brin matrice d'ADN dans la direction 5' vers 3' et synthétise une molécule d'ARN complémentaire en ajoutant séquentiellement des ribonucléotides dans la direction 5' vers 3'. Ce mécanisme d'appariement de bases garantit que la transcription de l'ARN est une copie précise de la matrice d'ADN, à l'exception de la présence d'uracile (U) à la place de la thymine (T), ce qui la rend adaptée à la traduction en protéines.