1. Archées (Archébactéries) : Les archées sont considérées comme l’une des premières formes de vie sur Terre et sont souvent appelées bactéries anciennes. Elles diffèrent considérablement des vraies bactéries en termes de structure cellulaire, d’organisation du génome et de métabolisme. Les archées ont une structure de membrane cellulaire distincte, des gènes uniques et diverses voies métaboliques, y compris la capacité de prospérer dans des environnements extrêmes comme les sources chaudes ou les sources hydrothermales des grands fonds.
2. Vraies bactéries (Eubactéries) : Le terme « vraies bactéries » fait souvent référence au domaine Bactéries, qui englobe une grande diversité d’espèces bactériennes. Les bactéries sont des organismes procaryotes caractérisés par une membrane cellulaire, un cytoplasme et de l'ADN, mais dépourvus de noyau ou d'organites liés à la membrane. Les espèces bactériennes comprennent des agents pathogènes courants comme Escherichia coli, ainsi que des bactéries bénéfiques impliquées dans le cycle des nutriments, la fixation de l'azote et la production d'antibiotiques.
3. Lignées bactériennes anciennes et modernes : Dans le domaine des bactéries, il existe des lignées qui ont divergé et ont évolué en groupes distincts au cours de l'histoire de l'évolution. Certaines bactéries peuvent être qualifiées d'« anciennes » parce qu'elles appartiennent à des lignées à ramifications profondes qui peuvent être apparues au début de l'évolution. Cependant, cette terminologie est relative et dépend du contexte de recherche spécifique et des relations évolutives étudiées.
En résumé, les « bactéries anciennes » désignent généralement les archées comme étant distinctes des bactéries, tandis que les « vraies bactéries » incluent diverses espèces bactériennes dans le domaine des bactéries. Ces termes doivent être interprétés avec prudence car la classification des bactéries repose sur des critères taxonomiques spécifiques plutôt que sur ces étiquettes simplifiées.
