Le microscope est utilisé dans une variété de domaines scientifiques à de nombreuses fins différentes. Que ce soit en médecine légale ou en médecine traditionnelle, le microscope est un instrument indispensable.
Analyse tissulaire

Il est courant pour les histologues d'étudier les cellules et les tissus à l'aide du microscope. Par exemple, si une section de tissu est prélevée pour analyse, les histologues peuvent utiliser un microscope en combinaison avec d'autres outils pour déterminer si l'échantillon est cancéreux.
Examen des preuves médico-légales

Les preuves recueillies sur une scène de crime peuvent contiennent des informations qui ne sont pas visibles à l'œil nu. Par exemple, les stries des balles peuvent être examinées au microscope pour voir si elles correspondent aux balles tirées d'un pistolet particulier.
Déterminer la santé d'un écosystème

Il est courant que les biologistes de terrain surveillent la santé des un écosystème particulier, tel qu'un cours d'eau, en utilisant des microscopes pour identifier le nombre et la diversité des organismes dans une région particulière au fil du temps.
Etudier le rôle d'une protéine dans une cellule

Les chercheurs trouvent des microscopes un outil précieux quand ils étudient la fonction des protéines dans les cellules. Avec la technologie d'aujourd'hui, de nombreuses protéines peuvent être étiquetées avec une étiquette et étudiées dans des cellules vivantes.
Étudier les structures atomiques

Des microscopes puissants tels que des microscopes à force atomique ont aidé les scientifiques à étudier la surface des atomes individuels.