Les ARNm dotés de structures complexes, tels que ceux contenant des structures secondaires étendues ou des nucléotides modifiés, nécessitent plus de temps et d'efforts pour que le ribosome puisse décoder et traduire. Cette complexité accrue de décodage peut entraîner des retards dans la synthèse des protéines et une plus grande probabilité d’erreurs ou de blocages lors de la traduction.
En conséquence, les ARNm dotés de structures plus complexes sont souvent traduits moins efficacement et ont une durée de vie plus courte que les ARNm dotés de structures plus simples. La machinerie cellulaire reconnaît et dégrade plus rapidement ces ARNm complexes pour empêcher l’accumulation de protéines non fonctionnelles ou mal repliées.
De plus, les ARNm dotés de structures complexes sont plus susceptibles d’être dégradés par les nucléases cellulaires, qui sont des enzymes qui décomposent les molécules d’ARN. Les structures secondaires complexes et les modifications présentes dans ces ARNm peuvent fournir des sites accessibles aux nucléases pour se lier et initier la dégradation.
De plus, la présence d’éléments régulateurs au sein de l’ARNm, tels que des régions non traduites (UTR) ou des sites de liaison des microARN, peut également influencer la stabilité de l’ARNm. Ces éléments peuvent moduler les interactions de l'ARNm avec les protéines de liaison à l'ARN, les miARN et d'autres facteurs régulateurs, affectant ainsi les taux de renouvellement de l'ARNm.
Par conséquent, les ARNm dont les schémas sont plus difficiles à déchiffrer ont des durées de vie plus courtes en raison de la complexité accrue du décodage, de la susceptibilité à la dégradation et de l’influence des éléments régulateurs, garantissant ainsi une expression génique et une fonction cellulaire efficaces.