1. Usines de transcription :
- Les usines de transcription sont des compartiments nucléaires où se produit la transcription active. Ils contiennent de fortes concentrations d’ARN polymérase II, de facteurs de transcription et d’autres protéines impliquées dans la transcription des gènes.
- Les usines de transcription interagissent avec des régions spécifiques des chromosomes appelées centres de transcription ou groupes de gènes. Ces pôles se caractérisent par une densité génétique élevée et une régulation coordonnée.
- Les interactions entre les usines de transcription et les chromosomes permettent d'organiser et de faciliter une transcription efficace de plusieurs gènes simultanément.
2. Taches nucléaires :
- Les taches nucléaires sont des structures sous-nucléaires enrichies en facteurs d'épissage d'ARN pré-messager (pré-ARNm) et en petites ribonucléoprotéines nucléaires (snRNP).
- Les taches nucléaires interagissent avec les transcrits d'ARN naissants à mesure qu'ils émergent des sites de transcription. Ils fournissent une plate-forme pour l’épissage pré-ARNm, où les introns sont retirés et les exons sont joints pour former un ARNm mature.
- Les interactions entre les taches nucléaires et les chromosomes facilitent le traitement et la maturation des transcrits d'ARN, assurant la production d'ARNm fonctionnel.
3. Régions d'attachement à la matrice nucléaire (MAR) :
- Les MAR sont des séquences d'ADN spécifiques qui se lient aux protéines et forment des attaches entre les chromosomes et la matrice nucléaire.
- Les MAR interagissent avec les structures nucléaires, telles que la lame nucléaire, et aident à organiser les chromosomes au sein du noyau.
- Les interactions entre les MAR et les chromosomes contribuent à l'organisation spatiale du génome, influençant l'expression des gènes et l'architecture nucléaire.
4. Interactions entre boucles de chromatine et amplificateurs :
- Les amas moléculaires peuvent servir de plaques tournantes pour le bouclage de la chromatine et les interactions à longue portée entre les éléments régulateurs (amplificateurs) et les promoteurs de gènes.
- Les Enhancers sont des séquences d'ADN qui contrôlent à distance l'expression des gènes. Ils peuvent boucler et interagir physiquement avec les promoteurs pour améliorer ou réprimer la transcription des gènes.
- Les clusters moléculaires, tels que les taches nucléaires ou les usines de transcription, peuvent servir de plates-formes où les activateurs et les promoteurs se réunissent, facilitant ainsi les interactions réglementaires à long terme.
En résumé, les amas moléculaires du noyau interagissent avec les chromosomes par divers mécanismes, notamment la formation d'usines de transcription, de taches nucléaires, de MAR et de boucles de chromatine. Ces interactions contribuent à la régulation de l’expression des gènes, au traitement de l’ARN et à l’organisation du génome au sein du noyau.
