1. Différences génétiques :Le chromosome Y est unique aux hommes et contient des gènes qui sont principalement responsables de la détermination et du développement du sexe masculin. Le chromosome Y de l’Homme de Néandertal porte un ensemble de gènes différents de ceux trouvés chez l’homme moderne.
2. Métiage et réussite reproductive :Lorsque les humains modernes (Homo sapiens) et les Néandertaliens (Homo neanderthalensis) se sont croisés, c'était principalement des mâles de Néandertal qui s'accouplent avec des femelles Homo sapiens. Cela a abouti à une progéniture avec de l'ADN mitochondrial de Néandertal (hérité de la mère) et une combinaison d'ADN nucléaire de Néandertal et d'Homo sapiens.
3. Incompatibilité génétique :Il semble que le chromosome Y de Néandertal ait eu du mal à se reproduire avec des femelles Homo sapiens. Le chromosome Y de Néandertal pourrait être porteur de variantes génétiques incompatibles avec les processus de reproduction humaine. Cette incompatibilité aurait pu entraîner une diminution de la fertilité ou des chances de grossesses réussies, conduisant à une plus faible prévalence des chromosomes Y de Néandertal dans les populations humaines modernes.
4. Sélection naturelle et adaptations :Pendant des milliers d'années, la sélection naturelle a favorisé la survie et la reproduction d'individus dotés de traits génétiques mieux adaptés aux conditions environnementales spécifiques et aux défis auxquels sont confrontés les humains modernes. Ce processus aurait favorisé la préservation de lignées de chromosomes Y humains plus performantes en termes d’aptitude à la reproduction et de survie.
En raison de ces facteurs, le chromosome Y de Néandertal est devenu de plus en plus rare et a finalement été exclu du pool génétique humain moderne. Par conséquent, l’ADN humain moderne ne contient pas de traces significatives d’ascendance néandertalienne sur le chromosome Y.