1. Bases de données de référence incomplètes ou mal étiquetées : l'exactitude des codes-barres ADN repose en grande partie sur l'exhaustivité et l'identification correcte des séquences de référence. Si la base de données de référence est incomplète ou contient des séquences mal étiquetées, cela peut conduire à des identifications incorrectes. Cela est particulièrement difficile pour les espèces nouvellement découvertes ou peu étudiées qui peuvent ne pas être représentées dans la base de données.
2. Variation intraspécifique :l'exactitude des codes-barres ADN suppose que la variation génétique au sein d'une espèce (variation intraspécifique) est inférieure à la divergence génétique entre les espèces (variation interspécifique). Cependant, dans certains cas, la variation intraspécifique peut être élevée, conduisant à des chevauchements entre les séquences de codes-barres d'ADN des espèces. Cela peut rendre difficile la différenciation entre des espèces étroitement apparentées ou cryptiques.
3. Individus hybrides :L'hybridation, le croisement d'espèces distinctes, peut donner naissance à des individus ayant des antécédents génétiques mixtes. L'analyse des codes-barres ADN d'individus hybrides peut s'avérer difficile, car ils peuvent présenter des motifs intermédiaires ou en mosaïque, ce qui rend difficile leur attribution à une seule espèce.
4. ADN ancien ou dégradé :lorsque vous travaillez avec des échantillons d'ADN anciens ou dégradés, la qualité et la quantité d'ADN obtenu peuvent être compromises. Cela peut affecter l'exactitude du code-barres ADN, car l'ADN dégradé peut contenir des séquences manquantes ou endommagées, ce qui pourrait avoir un impact sur l'identification des espèces.
5. Contamination de l'environnement :L'échantillonnage de l'ADN environnemental (ADNe) implique la collecte de matériel génétique provenant de sources environnementales telles que le sol, l'eau ou l'air. Cependant, les échantillons d’ADNe sont vulnérables à la contamination par des organismes non ciblés, ce qui entraîne des faux positifs ou une identification incorrecte des espèces.
6. Introgression mitochondriale :Dans certains cas, l'ADN mitochondrial (souvent utilisé pour les codes-barres ADN) peut être transféré entre espèces par hybridation ou d'autres processus évolutifs. Ce phénomène, connu sous le nom d'introgression mitochondriale, peut entraîner une discordance entre l'histoire évolutive de l'espèce et la séquence du code-barres ADN, conduisant potentiellement à des identifications incorrectes des espèces.
Il est crucial de reconnaître les limites et les sources potentielles d’erreur lors de l’interprétation des résultats des codes-barres ADN. Les chercheurs utilisent souvent des éléments de preuve supplémentaires, tels que des analyses morphologiques, des données écologiques et des séquences d’ADN nucléaire, pour corroborer et valider les identifications par codes-barres ADN, en particulier lorsqu’ils traitent des cas difficiles ou incertains.
