Toutes les formes de vie connues de l'humanité appartiennent à un soi-disant "royaume", mais il n'est pas toujours facile de savoir pourquoi une forme de vie appartient à un royaume donné et pas à un autre. Les royaumes Protista et Monera contiennent tous deux des formes de vie unicellulaires, mais ils sont distincts l'un de l'autre.
Nucleus

Une différence majeure entre les monerans et les protistes réside dans le noyau, qui est le "centre de commandement" de une cellule. Les Monerans n'ont pas de véritable noyau, tandis que les protistes ont des noyaux liés dans leurs propres membranes nucléaires. Les scientifiques classent les organismes avec de vrais noyaux comme eucaryotes et les organismes sans eux comme procaryotes.
Complexité

Au-delà de l'inclusion d'un vrai noyau, les protistes sont plus complexes sur le plan organisationnel que les monerans. Les protistes présentent des caractéristiques appelées organites qui ont divers emplois dans la cellule et peuvent présenter des méthodes de mouvement visibles. Les monerans n'ont pas ces types de caractéristiques.
Taille

Les tailles des différentes espèces dans chaque royaume varient, mais les protistes sont généralement plus grands que les monerans. Les protistes sont parfois visibles même avec seulement une loupe. Les monerans sont généralement beaucoup plus petits que cela. Cependant, les bactéries bleu-vert, qui appartiennent à la monera, sont plus grandes.