Avec le développement des technologies de séquençage du génome, de nombreux ARN longs non codants (lncRNA) ont été identifiés dans les fruits et légumes. Des recherches approfondies sur les ARNnc ont révélé leur rôle dans la régulation de l'expression des gènes codant pour les protéines aux niveaux transcriptionnel et post-transcriptionnel, jouant ainsi un rôle crucial dans la croissance, le développement et les réponses au stress des fruits et légumes.
Une nouvelle revue publiée dans Horticulture Research fournit un résumé complet de la compréhension actuelle de la formation, des caractéristiques fonctionnelles et des mécanismes de régulation des ARNnc dans les fruits et légumes.
En fonction de leur direction de transcription et de leur position par rapport aux gènes codant pour les protéines, les lncARN sont classés en quatre types :les lncARN intergéniques (lincRNA), les longs transcrits antisens non codants (lncNAT), les lncARN sens et les lncARN introniques (incRNA). Dans cet article, la formation et les caractéristiques fondamentales des ARNnc dans les fruits et légumes sont décrites sous trois aspects :l'abondance et la taille, la structure et la localisation, la décomposition et l'évolution.
Les rôles des lncARN dans les fruits et légumes ont été largement résumés et discutés dans des rapports de recherche récents, couvrant divers aspects, notamment l'accumulation de pigments, le développement des organes reproducteurs, la maturation des fruits, ainsi que les réponses aux carences en nutriments, au sel, à la sécheresse, à la température et aux bactéries pathogènes. .
De plus, les auteurs ont élucidé les mécanismes de régulation des ARNnc dans la régulation transcriptionnelle des gènes et l'épissage alternatif, ainsi que les interactions entre les ARNnc et les hormones végétales, les facteurs de transcription et les miARN.
Le développement de la technologie de séquençage à haut débit a considérablement amélioré la capacité de découvrir, prédire et identifier les ARNlnc. Cependant, il reste une rareté de données d'analyse complètes des ARNlnc dans les bases de données végétales concernant les ARNlnc présents dans les fruits et légumes, ce qui entrave la caractérisation de l'expression et de la localisation des ARNlnc.
De plus, le coût associé aux expériences de localisation subcellulaire des ARNlnc, tels que FISH, pose une limitation aux études sur les ARNlnc, soulignant le besoin urgent de développer des méthodes plus abordables pour la recherche sur les ARNlnc.
L'exploration de la fonction et du mécanisme des ARNlnc dans les cultures de fruits et légumes en est encore à ses débuts, et le développement rapide de la technologie apportera de nouvelles opportunités et percées pour la recherche sur les ARNlnc dans les fruits et légumes.
Plus d'informations : Xiuming Zhao et al, Rôles et mécanismes émergents des ARNnc dans les fruits et légumes, Recherche en horticulture (2024). DOI : 10.1093/hr/uhae046
Informations sur le journal : Recherche horticole
Fourni par l'Académie chinoise des sciences
