Les patients atteints de mucoviscidose ont une grande variété de bactéries dans leurs poumons, dont deux "prédateurs" non détectés auparavant, selon une nouvelle étude sur les micro-organismes pulmonaires publiée cette semaine dans mBio , une revue en ligne en libre accès de l'American Society for Microbiology.
En utilisant une technique de laboratoire appelée séquençage de nouvelle génération, un groupe d'enquêteurs de Madrid, Espagne, ont étudié la composition bactérienne d'échantillons d'expectorations fournis par 15 patients atteints de mucoviscidose trois à quatre fois au cours d'une année. Ils ont trouvé un large éventail d'espèces bactériennes dans les échantillons, comprenant Pseudomonas aeruginosa , Staphylococcus aureus , Burkholderia et Pandorée . Chaque patient avait sa propre composition bactérienne qui est restée relativement stable au cours de la période d'étude.
Ce qui a surpris les chercheurs, c'est également de trouver deux types de bactéries prédatrices parmi les échantillons. Vampirovibrio , une bactérie qui détruit les cellules en aspirant son contenu, a été trouvé dans 17 échantillons provenant de 12 patients, tandis que Bdellovibrio , qui pénètre dans les cellules et se nourrit de ses protéines, a été trouvé dans six échantillons provenant de trois patients. Les deux types ont été retrouvés ensemble chez un seul patient. Développer un nouveau modèle informatique pour expliquer la relation entre ces prédateurs et les bactéries proies potentielles, les enquêteurs ont émis l'hypothèse que les prédateurs, au stade précoce de la maladie, peut empêcher la colonisation de bactéries comme P. aeruginosa normalement associée à la mucoviscidose.
Les bactéries prédatrices « sont omniprésentes et se trouvent généralement dans les écosystèmes aquatiques environnementaux, " a déclaré l'auteur principal de l'étude Rosa del Campo, du service de microbiologie de l'hôpital universitaire Ramón y Cayal. « Chez l'homme, une étude récente les a trouvés dans le microbiote intestinal d'individus sains et de patients atteints de mucoviscidose."
Les résultats indiquent que « le microbiote pulmonaire chez les patients atteints de mucoviscidose est plus complexe qu'on ne le croyait, ", a-t-elle déclaré. "Notre étude suggère que les bactéries prédatrices pourraient être utilisées comme stratégie thérapeutique pour réduire la charge bactérienne des poumons de ces patients."
Del Campo et ses collègues ont analysé 56 échantillons d'expectorations de patients atteints de mucoviscidose dans son hôpital. Les patients ont été classés par altération de la fonction pulmonaire comme légère (cinq patients), modéré (neuf patients), ou sévère (un patient). Parmi les échantillons, ils ont trouvé 156 types de bactéries, comprenant Pseudomonas , Haemophilus , Staphylocoque , Pandore , Sphingomonas , Saccharibactéries genres incertae sedis , Stenotrophomonas , Leptotrichie , Capnocytophage , Burkholderia , Oribactérie , Aquabactérie , Lachnoanaérobaculum , Campylobacter et Mycoplasme . P. aeruginosa et S. aureus ont été retrouvés ensemble chez les huit patients présentant la fonction pulmonaire la plus faible.
L'évolution naturelle de la mucoviscidose est un déclin progressif de la fonction pulmonaire causé par un cercle vicieux d'inflammation et de destruction des tissus, qui est déclenchée et entretenue par la colonisation bactérienne chronique des voies respiratoires inférieures, a dit del Campo. « Il est généralement admis qu'une fois la colonisation bactérienne établie dans le poumon, son éradication est presque impossible, malgré un traitement antibiotique régulier, " elle a dit.
Les prochaines étapes pour son équipe comprennent la culture des bactéries prédatrices pour comprendre leur capacité à survivre dans les poumons et leur interaction avec les proies, et d'essayer d'utiliser des bactéries prédatrices pour contrôler le microbiote pulmonaire de la mucoviscidose, elle a dit.
