L'analyse de l'ADN implique différents types d'expériences moléculaires et de procédures biologiques. L'ADN est une matière première fragile et compliquée. La manipuler et l'analyser nécessite donc la meilleure qualité et la plus pure préparation de produits chimiques. Selon l'analyse, des centaines de produits chimiques, allant des solutions acides et basiques aux tampons et aux colorants, sont impliqués dans l'étude de l'ADN. Comprendre pourquoi certains produits chimiques sont utilisés est essentiel pour effectuer des expériences réussies et obtenir des résultats précis, fiables et reproductibles.
Ethylènediaminetétraacétate pour la purification de l'ADN
Trois types d'ADN sont purifiés pour un travail scientifique: l'ADN du le génome (ADN génomique), l'ADN entier de la cellule (ADN total) ou des plasmides, qui peuvent s'auto-multiplier. La purification de l'ADN cellulaire total utilise des produits chimiques qui permettent la destruction des nombreuses membranes cellulaires au cours de la lyse cellulaire. L'éthylènediaminetétraacétate (EDTA) chimique est souvent utilisé pour enlever les ions magnésium, qui sont nécessaires pour maintenir la rigidité des parois cellulaires, les affaiblissant au point qu'elles s'effondrent ou se déchirent, libérant le contenu de la cellule et l'ADN pour analyse. En outre, l'EDTA protège et préserve l'intégrité de l'ADN en inhibant les enzymes normalement présentes dans la cellule, qui peuvent fragmenter l'ADN et le rendre inutilisable.
Chlorure de Magneisum pour l'amplification de l'ADN
La réaction en chaîne de la polymérase (PCR) est une méthode d'analyse sophistiquée utilisée pour amplifier plusieurs milliers de copies d'une molécule d'ADN, mais elle est lourde de problèmes techniques et d'inexactitudes. De nombreux scientifiques, par conséquent, effectuent régulièrement plusieurs ensembles différents de PCR pour trouver la condition et les paramètres les plus optimaux pour un gène d'intérêt particulier. Un produit chimique utilisé pour effectuer une telle optimisation est le magnésium, qui stabilise l'enzyme ADN polymérase utilisée dans la PCR et agit comme un cofacteur essentiel pour l'activité de l'enzyme. Pour les PCR, le magnésium est utilisé sous forme de tampon au chlorure de magnésium.
Bromure d'éthidium pour la coloration de l'ADN
Le bromure d'éthidium est un colorant qui se lie à l'ADN en se glissant entre les nucléotides qui le composent une double hélice d'ADN dans un processus connu sous le nom d'intercalation. Ce colorant peut ensuite être illuminé avec une lampe ultraviolette, de sorte que l'ADN auquel le bromure d'éthidium a été lié peut être visualisé. Cependant, au moins 1 nanogramme d'ADN est nécessaire pour que le bromure d'éthidium soit bien vu, c'est donc un moyen de détecter l'ADN amplifié par PCR. Bien qu'il soit bon marché et largement utilisé, il s'agit également d'un produit chimique mutagène connu pour causer le cancer, de sorte que son utilisation dans les laboratoires est fortement réglementée et que de nombreux scientifiques optent pour des solutions moins toxiques.
