Il est important de noter que:
* L'inventeur exact est incertain. Certains historiens pensent que son père, Hans Janssen, peut avoir été impliqué, et il y a des affirmations selon lesquelles Cornelis Drebbel, un autre inventeur néerlandais, a également développé un appareil similaire à peu près au même moment.
* Ces premiers microscopes étaient très simples. Ils se composaient de deux objectifs dans un tube et fournissaient un grossissement limité.
Malgré l'incertitude, Zacharias Janssen est la figure la plus couramment reconnue associée à l'invention du premier microscope primitif.