ADN dans un nanocanal. Crédit :SISSA
Un moyen simple et efficace de démêler la masse d'ADN souvent enchevêtrée consiste à « enfiler » le brin dans un nano-canal. Une étude réalisée avec la participation de l'École internationale des hautes études de Trieste a utilisé des simulations pour mesurer les caractéristiques que ce canal devrait avoir pour atteindre une efficacité maximale.
Avec l'utilisation généralisée des méthodes d'analyse et de manipulation de l'ADN, il est certainement utile de trouver un moyen de démêler et de détendre les brins de cette molécule qui a tendance à s'emmêler spontanément. Une façon est d'utiliser des canaux, ou plutôt nano-canaux, comme Cristian Micheletti, Chercheur SISSA, et Enzo Orlandini, de l'Université de Padoue, fait dans une étude qui vient d'être publiée dans la revue Lettres macro .
L'idée est de forcer l'ADN dans le canal afin de le détendre complètement. "Mais n'importe quelle chaîne ne fera pas l'affaire, " explique Micheletti. " En fonction du diamètre du nano-canal, les extrémités des brins peuvent s'agencer en structures en forme de crochet qui finiront par former un nœud".
« Dans notre étude, nous avons utilisé des techniques de simulation pour caractériser les mécanismes conduisant à la formation de nœuds en fonction du diamètre du canal », Micheletti continue.