Les mouches tsé-tsé contractent l'infection lorsqu'elles se nourrissent du sang d'un animal infecté. Les parasites se développent au sein de la mouche et, après un certain temps, la mouche devient infectieuse. Lorsqu'une mouche infectée mord un autre animal, les parasites sont transmis par la salive de la mouche et pénètrent dans la circulation sanguine du nouvel hôte.
Au sein du nouvel hôte, les parasites se multiplient et se propagent dans la circulation sanguine et les tissus, provoquant divers symptômes, notamment de la fièvre, une faiblesse, une perte de poids, une anémie et des problèmes neurologiques. S'il n'est pas traité, le nagana peut être mortel.
La transmission du nagana par les mouches tsé-tsé est un processus complexe impliquant plusieurs facteurs, notamment l'espèce de mouche tsé-tsé, l'espèce de parasite Trypanosoma et la réponse immunitaire de l'animal hôte. Différentes espèces de mouches tsé-tsé présentent différents degrés de sensibilité à l’infection par différentes espèces de Trypanosoma, et certaines espèces d’animaux sont plus sensibles à la maladie que d’autres.
La lutte contre le nagana est un défi en raison de la large répartition des mouches tsé-tsé et de la difficulté de traiter et de prévenir la maladie. Diverses méthodes sont utilisées pour lutter contre la maladie, notamment l'utilisation d'insecticides pour tuer les mouches tsé-tsé, l'utilisation de médicaments pour traiter les animaux infectés et l'utilisation de pièges et d'autres méthodes pour réduire le contact entre les mouches tsé-tsé et le bétail.