Les forêts tropicales humides sont l'un des habitats les plus biologiquement diversifiés de la planète, mais la description de la flore et de la faune et la compréhension de leur histoire évolutive sont loin d'être complètes. Comme ils sont une source de ressources durables, y compris des produits pharmaceutiques potentiels, cuisine et bois, il est de plus en plus nécessaire d'évaluer les changements de la biodiversité mondiale.

Le projet GLDAFRICA a choisi d'étudier une sous-famille des légumineuses, les Detarioideae, pour étudier les modèles géographiques de la richesse des espèces. « En utilisant le séquençage de nouvelle génération, nous voulons identifier les points chauds de la diversité évolutive et les récents événements de spéciation en Afrique du centre-ouest, " souligne le Dr Felix Forest, coordinateur de projet.

Construire les branches pour arriver à l'arbre

Extraire les séquences d'ADN appropriées à partir de quelques marqueurs plastidiques, l'équipe a utilisé des méthodes standard pour reconstruire les relations évolutives ou phylogénétiques entre les membres du groupe. "Nous avons ensuite utilisé l'arbre résultant pour étudier les modèles biogéographiques et les changements de biome au sein de la sous-famille, " poursuit le Dr Forest. Les biomes ont une portée plus large que l'habitat, étant des communautés qui se sont adaptées en réponse à un climat physique partagé.

L'étape suivante consistait à rassembler beaucoup plus de données sur les séquences d'ADN, ce qui devrait aboutir à un arbre phylogénétique plus détaillé. Le boursier du projet GLDAFRICA, Dr Manuel de la Estrella, développé une approche d'enrichissement ciblé qui permet un arbre mieux résolu avec des relations évolutives plus détaillées. "Le résultat a été que nous avons pu séquencer quelques centaines de marqueurs du noyau. Les analyses sont en cours et le nouvel arbre est attendu dans les prochains mois, " Le Dr Forest nous a informés.

Un résultat clé à ce jour est que le travail a été utilisé comme preuve pour une nouvelle classification dans la sous-famille des légumineuses. « La tribu Detarioideae a récemment été élevée au niveau de sous-famille et est maintenant nommée sous-famille Detarioideae, " explique le Dr Forest. " Une analyse plus approfondie changera très probablement la façon dont nous voyons l'évolution de cet important groupe de plantes d'Afrique de l'Ouest. "

Regard sur l'évaluation future de la conservation et les menaces pour les espèces

Les évaluations de la conservation de l'Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) sont un autre livrable, et « ceux-ci seront utilisés pour produire une liste EDGE [distincte sur le plan de l'évolution et en danger à l'échelle mondiale] des espèces distinctes les plus menacées et les plus évolutives du groupe Detarioideae, " déclare le Dr Forest.

L'utilisation des données peut être étendue aux prévisions quant à l'endroit où l'espèce se retrouvera dans l'arbre selon différents scénarios de changement climatique. "Quand tout le travail de bêche a été fait, nous utiliserons la modélisation des espèces et les prévisions du Groupe d'experts intergouvernemental sur l'évolution du climat pour examiner le devenir des espèces à l'avenir. »

La quantité de données produites dépasse largement ce qui était initialement prévu pour le projet et l'équipe travaille toujours sur l'analyse pour les résultats finaux et la publication. Déjà publiés sont deux articles sur l'évolution des Detarioideae, un dans Nouveau phytologue et l'autre dans le Revue internationale des sciences végétales .

"GLDAFRICA s'est concentré sur la sous-famille Detarioideae d'Afrique de l'Ouest. La prochaine étape consiste à étendre cette étude aux espèces néotropicales. Nous avons déjà obtenu un financement pilote pour explorer la faisabilité de cela et cela semble très prometteur, " conclut le Dr Forest.

L'arbre phylogénétique issu de la recherche GLDAFRICA sera le plus complet pour un si grand groupe de légumineuses. Compte tenu de l'importance éco-économique de ce groupe dans les forêts tropicales d'Afrique de l'Ouest, il servira de base à de nombreuses études évolutives qui se pencheront sur l'évolution et l'écologie de ces écosystèmes étonnants.