Cependant, il y a des points importants à considérer:
* Modifications conformationnelles: Les enzymes peuvent subir temporaire changements conformationnels pendant la réaction. Ces changements sont souvent subtils et permettent à l'enzyme de se lier au substrat, de faciliter la réaction, puis de revenir à sa forme d'origine.
* Sites catalytiques: Le site actif d'une enzyme, où la réaction se produit, peut être modifié pendant la réaction. Cette modification est souvent réversible et permet à l'enzyme de se lier aux liaisons du substrat, de casser ou de former et de libérer le produit.
* coenzymes: Certaines enzymes nécessitent des cofacteurs, tels que des coenzymes, pour fonctionner. Les coenzymes peuvent être modifiées pendant la réaction mais sont régénérées à leur forme d'origine pour les cycles ultérieurs.
Par conséquent, alors que les enzymes eux-mêmes ne changent pas de façon permanente pendant une réaction, leur structure et leur site actif peuvent subir des altérations temporaires pour faciliter la réaction.