L'éther est un solvant hautement inflammable et volatil, et l'utilisation d'une filtration par aspiration avec de l'éther peut créer une situation dangereuse en raison du risque d'inflammation. L'aspiration appliquée lors de la filtration peut créer de l'électricité statique, qui peut enflammer les vapeurs d'éther. De plus, les vapeurs d'éther peuvent former des peroxydes explosifs lors de l'exposition à l'air et à la lumière.
Au lieu de la filtration par aspiration, d'autres méthodes telles que la filtration par gravité ou la filtration à l'aide d'un entonnoir Büchner avec un papier filtre doivent être envisagées pour les solutions contenant de l'éther. Ces méthodes n’impliquent pas l’utilisation d’aspiration et sont donc plus sûres pour les solvants inflammables comme l’éther.