Les acides aminés contiennent également un groupe aminé (-NH2), qui est un groupe basique. Le groupe amino peut accepter un ion hydrogène (H+), ce qui donne à l’acide aminé une charge positive nette. C’est cette charge positive qui confère aux acides aminés leurs propriétés fondamentales.
L'équilibre entre les groupes acides et basiques des acides aminés détermine leur charge globale. À pH neutre, la plupart des acides aminés ont une charge nette négative car le groupe carboxyle est plus acide que le groupe amino. Cependant, certains acides aminés, comme la lysine et l’arginine, possèdent plus de groupes basiques que de groupes acides et ont donc une charge nette positive à pH neutre.
