Certains des contaminants potentiels trouvés dans la lagune d’Indian River comprennent :
* Nutrients : L’excès de nutriments provenant des engrais et du ruissellement des eaux usées peut entraîner une prolifération d’algues et d’autres problèmes de qualité de l’eau. Les proliférations d'algues peuvent produire des toxines qui peuvent être nocives pour les humains et la faune.
* Bactéries : Les bactéries provenant des déchets humains et animaux peuvent contaminer le lagon et provoquer des maladies gastro-intestinales chez les personnes qui entrent en contact avec l'eau.
* Pesticides : Les pesticides utilisés dans l'agriculture et l'entretien des pelouses peuvent également contaminer la lagune et présenter un risque pour la santé des humains et de la faune.
* Métaux lourds : Les métaux lourds comme le plomb et le mercure peuvent s'accumuler dans les tissus des poissons et d'autres organismes aquatiques et présenter un risque pour la santé des humains qui consomment ces organismes.
Le FDEP conseille aux gens de toujours suivre les derniers avis de santé lorsqu'ils se baignent, pêchent ou participent à d'autres activités dans la lagune d'Indian River. Le ministère encourage également les gens à prendre des mesures pour réduire leur impact environnemental, comme utiliser avec parcimonie les engrais et les pesticides et éliminer correctement les déchets humains et animaux.