L'activité antivirale de dix échantillons de substances humiques (HS) a été évaluée contre la reproduction du virus de l'encéphalite à tiques. Pour révéler d'éventuels composants actifs des échantillons HS, les données FTICR MS ont été recherchées dans la base de données ChEMBL. Plusieurs structures possédant un profil d'activité antivirale similaire et des résultats d'échange isotopique correspondants ont été identifiées. Crédit :Orlov A.A. (Skoltech)
Des scientifiques russes ont démontré une nouvelle approche tirant parti de la spectrométrie de masse à haute résolution et de la chimioinformatique pour identifier les composants moléculaires biologiquement actifs des substances humiques extraites du charbon, et découvert des substances ayant une activité antivirale contre le virus de l'encéphalite à tiques. Les résultats de leur étude ont été publiés dans le Rapports scientifiques journal.
Mélanges naturels à plusieurs composants, telles que les substances humiques présentes dans le sol, la tourbe et le charbon sont une source très importante de composés biologiquement actifs. Comprendre leur composition et extraire les composants actifs peut être d'une grande aide dans la création de nouveaux médicaments. Cependant, trouver un composé spécifique dans ces environnements est une tâche très difficile qui nécessite des méthodes avancées capables de différencier et de séparer une substance d'une autre.
Une étude conjointe menée par des scientifiques de l'Institut des sciences et technologies de Skolkovo (Skoltech) et des collaborateurs institutionnels a révélé que les substances humiques inhibent la reproduction d'un agent pathogène humain dangereux, virus de l'encéphalite à tiques. Les auteurs se sont appuyés sur la spectrométrie de masse à haute résolution pour étudier la composition des échantillons humiques et la chimioinformatique pour analyser leurs résultats. Ils ont comparé les résultats à de vastes bases de données de composés chimiques et identifié les caractéristiques structurelles des composés qui pourraient être responsables de leur activité virucide. Les résultats de l'analyse des données attestent clairement de l'importance des fragments centraux naturels de flavonoïdes et de polyphénols, deux classes de composés naturels à activité biologique étendue.
"Nous avons tenté de comprendre les raisons structurelles derrière l'activité antivirale des composants moléculaires des substances humiques. Conscients que les méthodes standard de séparation de mélanges complexes ne fonctionnent pas pour les substances humiques, nous avons regardé quelques structures connues correspondant aux compositions moléculaires déterminables par spectrométrie de masse et avons remarqué que certaines structures correspondent à des composés souvent extraits de sources naturelles, par exemple, flavonoïdes. Nous avons entrepris d'autres expériences de spectrométrie de masse, qui suggèrent qu'il peut effectivement y avoir une correspondance entre les types de structures que nous avons trouvés dans les bases de données et les composants moléculaires des systèmes humiques, " dit l'un des auteurs de l'étude et chercheur scientifique chez Skoltech, Alexandre Zherebker, doctorat
Les résultats de l'étude peuvent servir de tremplin vers une recherche détaillée sur les mécanismes moléculaires de l'activité biologique présentés par les substances humiques et d'autres mélanges naturels à plusieurs composants inséparables et l'évaluation de leur potentiel pharmaceutique.
