Une étude multidisciplinaire menée par le Groupe de recherche en biochimie informatique de l'Universitat Jaume I (UJI) et ses collaborateurs ont conçu de petites molécules capables de se lier à et d'inhiber l'activité des enzymes dans les maladies infectieuses. Les conclusions de ce travail, développé en collaboration avec l'Université Simon Fraser de Saint Andrews, ont été publiés dans la revue Communication Nature .
La recherche a montré comment de nouvelles molécules, semblable aux glucides mais plus petit, se lier avec les enzymes qui sont responsables de leur dégradation, glucosidases. « Nous avons synthétisé de nouvelles molécules, pris de nouvelles mesures de leur activité inhibitrice, obtenu des structures par diffraction des rayons X puis réalisé des simulations informatiques sur l'ensemble du processus, " explique le responsable du groupe Biochimie informatique, Vicent Moliner. Les résultats ont montré la capacité de ces nouvelles molécules à inhiber l'activité de ce type spécifique d'enzymes glycosides.
Moliner, professeur de Chimie Physique à l'UJI, estime que cette étude « peut représenter la première étape de la conception de nouveaux médicaments, " car les glycosides ne sont pas seulement des enzymes essentielles pour digérer les glucides, mais ils sont aussi des acteurs clés des infections causées par des agents pathogènes, dans la défense antibactérienne et de nombreux autres processus cellulaires vitaux.
Les données obtenues par simulations informatiques coïncident avec les données expérimentales de leurs collègues au Canada et au Royaume-Uni et permettent d'expliquer comment ces inhibiteurs se lient à l'enzyme. "L'étude a permis de décrire au niveau moléculaire comment inhiber l'activité d'un type important d'enzymes, glycosides. Le type d'union entre ces molécules et l'enzyme est très fort, afin qu'ils soient la semence de nouveaux médicaments, " dit Moliner.
Collaboration expérimentale et théorique
« La collaboration entre les groupes expérimentaux et théoriques est, comme l'a récemment souligné l'Académie suédoise des sciences lors de la cérémonie de remise du prix Nobel, pilier du développement des connaissances. Par ailleurs, il est crucial pour les chercheurs eux-mêmes, car il leur permet de réunir les pièces du puzzle que sont les nombreux résultats de différents laboratoires, " ajoute un chercheur du même groupe UJI, Katarzyna widerek.
Vicent Moliner est professeur de chimie physique à l'Universitat Jaume I et chercheur en chef du Computer Biochemistry Group. Le docteur Katarzyna Świderek est chercheuse dans le même groupe avec un contrat Juan de la Cierva, décerné par le Département des sciences, Innovation et Universités. Le groupe développe et applique des méthodes théoriques pour l'étude des processus biologiques à travers des simulations avec des ordinateurs haute performance. Récemment, ce groupe UJI a révélé comment les enzymes fonctionnent dans les systèmes liés aux processus dégénératifs tels que la maladie d'Alzheimer.
