Des chercheurs japonais ont créé une base de données de métabolites à partir d'échantillons de sang prélevés sur plus de 5, 000 volontaires japonais, en le rendant disponible gratuitement en ligne en tant que ressource précieuse pour les chercheurs du monde entier.

Les métabolites et les protéines contrôlent de nombreux processus à l'intérieur de notre corps, et informent également l'interaction entre nos cellules et leur environnement. Comprendre davantage ces composés et leurs relations les uns avec les autres, pourrait aider les chercheurs à évaluer l'état de santé des personnes et à développer de nouveaux traitements personnalisés pour diverses maladies.

La base de données, que le scientifique en bio-informatique Shu Tadaka de l'Université de Tohoku et ses collègues ont appelé jMorp, contient des informations sur 306 métabolites et 256 protéines communes trouvées chez l'homme. Cela inclut leur fréquence, concentration, et à quelle fréquence ils sont apparus chez les hommes ou les femmes et à quel âge. La base de données est unique en ce sens, au lieu de simplement afficher des données brutes, il offre aux visiteurs une chance de voir comment les différents métabolites sont corrélés les uns aux autres graphiquement, ouvrant la voie à d'autres études pour identifier comment ces métabolites et protéines sont liés les uns aux autres.

"Les informations dans jMorp sont obtenues à partir de données statistiques créées en agrégeant des données individuelles, " dit Tadaka. " Un comité indépendant a soigneusement examiné toutes les questions éthiques avant de nous autoriser l'accès à ces données. "

Des bases de données similaires couvrent d'autres pays ou régions, comme le Royaume-Uni et la République d'Irlande, mais certains ont des limites en raison de la collecte de données incohérente ou de la petite taille de l'échantillon. Le grand nombre d'individus en bonne santé qui ont fourni des échantillons à jMorp le rend particulièrement utile. Les chercheurs ont également collecté et analysé des données selon la même méthode et dans le même institut, ce qui minimise les erreurs de mesure. En outre, ils ont pris des mesures supplémentaires pour exclure tout échantillon de mauvaise qualité et pour assurer le contrôle de la qualité tout au long du processus de collecte, stocker et analyser les échantillons de plasma. Ceux-ci rendent jMorp particulièrement fiable en tant que ressource pour les scientifiques, en particulier les biochimistes et les chercheurs médicaux.

Pour le rendre pertinent et utile aux autres chercheurs, l'équipe japonaise a configuré jMorp dans un format convivial qui permet aux visiteurs d'accéder facilement aux données dont ils ont besoin, ainsi que des comparaisons et des relations entre différents composés affichés visuellement. Les utilisateurs peuvent rechercher le type de composé qu'ils recherchent par nom ou par spécifications. Le résumé des données peut être téléchargé et les graphiques de corrélation peuvent être enregistrés sous forme de fichiers image.

La base de données est un effort continu et les chercheurs produisent des versions annuelles mises à jour à mesure qu'ils collectent et analysent davantage d'échantillons. Ils prévoient également d'offrir plus d'informations sur les métabolites et les protéines qu'ils documentent en appliquant de nouvelles méthodes d'analyse.