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    Détermination de la structure 3-D des phages à résolution atomique

    Vue d'artiste de phages (vert et jaune) attaquant une bactérie (bleu). Crédit :Barth van Rossum, FMP

    Les phages sont devenus un axe de recherche dans la lutte contre la résistance aux antibiotiques. Ces virus mangeurs de bactéries se sont déjà révélés efficaces dans des expériences contre des bactéries multirésistantes. Cependant, la structure atomique de ces petits assistants est inconnue. Des chercheurs du Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP) à Berlin ont maintenant réussi à développer une nouvelle méthode qui permet de déterminer en détail la structure complexe, jusqu'au niveau atomique. Leurs travaux constituent un développement ultérieur de la RMN du solide et ont été publiés dans des revues spécialisées. Angewandte Chemie et Protocoles naturels .

    L'OMS a longtemps qualifié la résistance aux antibiotiques de crise sanitaire mondiale et publié une liste de germes problématiques, plus récemment en mars, pour lesquels de nouveaux antibiotiques sont nécessaires de toute urgence. Mais la recherche de nouveaux antibiotiques s'est avérée difficile :il n'y a eu aucun progrès significatif dans le développement depuis plus de 40 ans. C'est pourquoi les chercheurs sont plus que jamais à la recherche de traitements alternatifs. Les phages pourraient constituer une telle alternative. Ce sont des virus naturels qui attaquent et consomment certaines bactéries, c'est pourquoi on les appelle aussi « bactériophages » (du grec ancien φαγεῖν phageín, "Dévorer"). Comme il existe des phages spéciaux pour chaque bactérie, il apparaît qu'ils peuvent être déployés plus spécifiquement que les antibiotiques, qui tuent toujours aussi les « bonnes » bactéries. De nombreuses expériences avec des bactériophages ont déjà été réalisées en Europe de l'Est, et aux États-Unis, ils ont été génétiquement manipulés afin de pouvoir guérir les infections de germes multirésistants chez la souris.

    La structure atomique des phages n'est pas entièrement connue à ce jour. Au cours du développement thérapeutique actuel, cependant, il serait extrêmement utile de savoir exactement comment ils fonctionnent et à quoi ressemble leur structure 3D au niveau des détails atomiques. « Les phages sont des nanomachines optimisées par la nature depuis des millions d'années. Ils sont constitués de nombreux composants assemblés en une architecture complexe, " explique le professeur Dr. Adam Lange (FMP). Lange et son équipe ont maintenant réussi à franchir une étape méthodologique :les chercheurs ont développé des méthodes de RMN (spectroscopie de résonance magnétique nucléaire) à l'état solide afin qu'elles puissent être utilisées pour déterminer la structure de phages jusqu'au niveau atomique. Lange estime qu'il lui faudra environ un an pour résoudre la structure complexe des phages. "En effectuant cette recherche fondamentale, nous pouvons apporter une contribution importante à la phagothérapie."

    La nouvelle méthode peut également être appliquée à d'autres systèmes importants. Pour donner accès aux laboratoires du monde entier, en plus du papier dans Angewandte Chemie les chercheurs ont publié un protocole détaillé dans Protocoles naturels .

    « Les bactériophages deviennent de plus en plus importants en tant qu'approche thérapeutique alternative en raison de la résistance de nombreuses souches de bactéries pathogènes aux antibiotiques, " conclut Lange. Il est l'un des plus grands esprits dans le domaine de la visibilité des structures protéiques par RMN. " Par conséquent, nous allons maintenant mettre notre développement technologique à profit et étudier leur structure complexe le plus rapidement possible."


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