1. Bactéries: Procaryotes monocellulaires (sans noyau) avec diverses formes, tailles et capacités métaboliques. Ils se trouvent dans tous les environnements et jouent un rôle crucial dans les écosystèmes et la santé humaine.

2. Archaea: Les procaryotes mono-celluriques distincts des bactéries, souvent trouvés dans des environnements extrêmes comme les sources chaudes et les lacs de sel. Ils sont également essentiels dans divers écosystèmes et ont des applications potentielles en biotechnologie.

3. champignons: Organismes eucaryotes (avec un noyau) qui comprennent des levures, des moules et des champignons. Ce sont des décomposeurs importants et jouent un rôle dans la production alimentaire et la médecine.

4. Protozoa: Organismes eucaryotes unicellulaires avec un large éventail de formes et de cycles de vie. Ils sont divers dans leurs habitats et sont impliqués dans les chaînes alimentaires et la transmission des maladies.

5. Virus: Entités non vivantes constituées de matériel génétique (ADN ou ARN) enfermé dans une couche protéique. Ils nécessitent une cellule hôte pour se reproduire et peuvent provoquer diverses maladies.

Il est important de noter que même si ce sont les cinq groupes principaux, il existe d'autres micro-organismes tels que algues (Organismes eucaryotes qui effectuent la photosynthèse), prions (protéines mal repliées qui peuvent provoquer des maladies) et viroïdes (petites molécules d'ARN infectieuses). Cependant, ceux-ci ne sont souvent pas inclus dans les "cinq groupes de base" car ils sont moins diversifiés ou ont des rôles plus spécialisés par rapport aux cinq mentionnés ci-dessus.