Les flagelles sont des structures de fouet qui tournent pour propulser les bactéries à travers son environnement. Ils sont faits de protéines et peuvent être disposés en différents schémas, comme un seul flagelle à une extrémité (monotrichous), une touffe de flagelles à une extrémité (lophotrichous), des flagelles sur toute la surface (péritrichous), ou un flagelle à chaque extrémité (amphitrichous).