Les ARN polymérases sont des enzymes responsables de la transcription de l'ADN dans l'ARN. Différents types d'ARN polymérases existent dans les eucaryotes et les procaryotes, chacun avec ses fonctions spécifiques et ses séquences de reconnaissance des promoteurs.
* ARN polymérase (RNAP) :L'ARN polymérase unique dans les procaryotes transcrit tous les types d'ARN (ARNm, ARNt, ARNr).
* Structure du promoteur:
* -10 élément (boîte de pribnow): Séquence Tataat située environ 10 paires de bases en amont du site de démarrage de transcription.
* -35 élément: Séquence TTGACA située environ 35 paires de bases en amont du site de démarrage de transcription.
* Éléments en amont: Certains promoteurs ont des éléments supplémentaires plus en amont, influençant l'efficacité de la transcription.
* ARN polymérase I (Pol I): Responsable de la transcription des gènes d'ARN ribosomal (ARNr).
* Structure du promoteur:
* Promoteur de base: Une région contenant un élément central et un élément de contrôle en amont (UCE).
* élément central: Une courte séquence située à environ 40 pb en amont du site de début de transcription.
* uce: Une région située à environ 100 pb en amont du site de début de transcription, contenant souvent une séquence conservée appelée "élément en amont" (UE).
* ARN polymérase II (Pol II): Transcrit les gènes codant pour protéines (ARNm) et certains petits gènes d'ARN nucléaire (SNRNA).
* Structure du promoteur:
* Promoteur de base: Contient généralement les éléments suivants:
* Tata Box: Une séquence conservée située à environ 25-30 pb en amont du site de début de transcription.
* Initiateur (INR): Une séquence située autour du site de démarrage de la transcription.
* Élément promotateur en aval (DPE): Situé en aval du site de démarrage de la transcription.
* Bre (élément de reconnaissance tfiib): Une séquence située en amont de la boîte TATA, reconnue par le facteur de transcription IIB (TFIIB).
* Éléments réglementaires en amont: Ces éléments peuvent être situés des centaines, voire des milliers de paires de bases en amont du promoteur de base et influencent le taux de transcription. Les exemples incluent:
* CAAT Box: Une séquence consensuelle qui lie les facteurs de transcription.
* Boîte GC: Une séquence riche en GC reconnue par des facteurs de transcription.
* Enhancers: Les séquences d'ADN qui peuvent stimuler la transcription, souvent située loin du promoteur central.
* ARN polymérase III (Pol III): Transcrit l'ARN de transfert (ARNt), le 5S ribosomal ARN (ARNr 5S) et certains petits gènes d'ARN nucléaire (SNRNA).
* Structure du promoteur:
* Promoteur interne: Situé dans la région transcrite pour les gènes d'ARNt et d'ARNr 5S.
* promoteur en amont: Situé en amont de la région transcrite pour certains gènes de SNRNA.
| ARN polymérase | Transcriptions | Promoteurs |
| --- | --- | --- |
| Procaryotic rnap | ARNm, ARNt, ARNr | -10 élément, -35 élément, éléments en amont |
| Eucaryotic pol i | ARNr | Promoteur de base, Uce |
| Eucaryote Pol II | ARNm, un peu de snRNA | Promoteur de base (Tata Box, INR, DPE, BRE), Éléments réglementaires en amont |
| Eucaryote Pol III | TRNA, 5s ARNr, un peu de snRNA | Promoteur interne (pour l'ARNt, 5s ARNr), promoteur en amont (pour un peu de snRNA) |
Ce tableau n'est pas exhaustif, car différents types de promoteurs et leurs éléments réglementaires existent au sein de chaque groupe. Les séquences et structures spécifiques des promoteurs peuvent varier, influençant l'efficacité et la régulation de la transcription.
