Il était une figure clé pour réfuter la théorie de la génération spontanée, s'appuyant sur les travaux de Francesco Redi. Spallanzani a mené des expériences utilisant des flacons scellés et du bouillon bouilli, démontrant que les micro-organismes ne se sont pas produit spontanément mais ont plutôt été introduits à partir de l'air. Cela a aidé à consolider le concept de biogenèse - l'idée que les êtres vivants ne découlent que d'autres êtres vivants.