1. Interactions virus-hôte :
- Étudier les interactions moléculaires entre les protéines virales et les facteurs de l'hôte, tels que les récepteurs de surface cellulaire, les composants endosomaux et les molécules immunitaires.
- Évaluer la capacité du virus à pénétrer dans différents types de cellules hôtes, ainsi que ses mécanismes pour échapper ou supprimer les réponses immunitaires cellulaires.
2. Variation génétique virale :
- Analyser le génome viral à la recherche de mutations et de variations de séquence qui améliorent ou modifient sa transmissibilité.
- Comparer les génomes de virus étroitement apparentés et identifier les variations associées à différents niveaux d'efficacité de transmission.
3. Fitness viral :
- Mesurer l'aptitude à la réplication du virus dans différents organismes hôtes ou modèles de culture cellulaire.
- Tenez compte de facteurs tels que le taux de réplication, la charge virale et la capacité d'établir des infections persistantes ou latentes.
4. Transmission et épidémiologie :
- Étudier le mode de transmission du virus. Est-ce principalement par le biais de gouttelettes respiratoires, de vecteurs passifs, de contacts étroits ou de vecteurs ?
- Comprendre la dynamique de la transmission, telle que le nombre reproducteur de base (R0) et l'intervalle sériel.
- Analyser les données épidémiologiques et les schémas d'épidémies pour identifier les facteurs qui contribuent à une transmission efficace.
5. Facteurs environnementaux :
- Examiner comment les conditions environnementales, telles que la température, l'humidité et le rayonnement UV, influencent la survie, la transmission et l'infectivité du virus.
- Évaluer l'impact des changements ou des perturbations environnementales sur les modes de transmission du virus.
6. Caractéristiques de la population hôte :
- Tenir compte des facteurs démographiques tels que les niveaux d’immunité, la démographie et les problèmes de santé sous-jacents qui peuvent avoir un impact sur la susceptibilité à l’infection et à la transmission.
7. Réservoirs animaux et potentiel zoonotique :
- Rechercher le rôle des réservoirs animaux dans le maintien des souches virales et le potentiel de transmission zoonotique.
- Analyser les facteurs écologiques qui contribuent à l'émergence de maladies virales des animaux à l'homme.
8. Réponses immunitaires de l'hôte :
- Étudier l'interaction entre les facteurs viraux et les réponses immunitaires de l'hôte, y compris la capacité du virus à échapper à la détection, à bloquer les mécanismes antiviraux ou à atténuer les réponses immunitaires.
- Analyser l'efficacité des réponses immunitaires humorales et à médiation cellulaire dans le contrôle des infections virales.
9. Modélisation mathématique et analyse phylogénétique :
- Utiliser des modèles mathématiques et des analyses phylogénétiques pour déduire la dynamique de transmission, les modèles évolutifs et l'adéquation relative des différentes souches virales.
10. Collaboration et partage de données :
- Encourager les collaborations de recherche interdisciplinaires et le partage de données entre virologues, épidémiologistes, biologistes et experts dans d'autres domaines pertinents.