Les organigrammes bactériens fournissent une aide visuelle pour une identification rapide des espèces bactériennes. Pour créer un organigramme, identifiez d'abord les caractéristiques communes des différents groupes de bactéries pour exclure les groupes non pertinents et pour déterminer plus efficacement les bactéries présentes. Une variété de logiciels ont les éléments géométriques nécessaires pour traiter un groupe à la fois, par coloration de Gram et forme. Une espèce commune de bactéries de la peau, Staphylococcus aureus, offre un excellent point de départ, avec chaque étape de l'organigramme définie dans une forme géométrique telle qu'un rectangle, un ovale, un carré ou une boîte avec des lignes reliant chaque étape suivante en dessous pour les organigrammes alignés en mode portrait et horizontalement pour les cartes orientées paysage.
Spécifiez que la culture à tester est une culture pure. Identifiez également l'origine de l'échantillon pour réduire la plage de l'organigramme.
Écrivez ou tapez "Gram Stain" comme test principal et créez deux ramifications à partir de cette boîte. Marquez les ramifications «Gram positif» et «Gram négatif». Les taches à Gram positif, comme Staphylococcus, semblent violettes et les taches à Gram négatif, comme E. coli, sont rouges. Les bactéries sont divisées en ces deux groupes et la coloration de Gram est le premier test effectué sur un échantillon inconnu, car il s'agit d'une procédure simple et peu coûteuse qui permet d'éliminer un grand pourcentage de possibilités.
Entrez les options suivantes dans une boîte ou une autre forme sur l'organigramme, qui identifie la forme des bactéries obtenues à partir de l'analyse microscopique de la coloration de Gram. Les types de formes sont les tiges, les cocci, les sphères ou les ovoïdes, les spirilles, les tiges torsadées en spirale, les spirochètes, les tiges torsadées très fines en spirale longue, avec des bourgeons et des appendices et des parties filamenteuses et filiformes. Les bâtonnets et les cocci sont les plus courants. Staphylococcus s'identifie comme coccus.
Divisez les étapes, boîtes ou autres formes de choix suivantes, en tests biochimiques pour chaque branche de l'organigramme. Ceux-ci diffèrent pour les différentes formes des groupements Gram. Le test principal pour les cocci à Gram positif est le test à la catalase utilisant du peroxyde d'hydrogène, et les options résultantes sont soit catalase positive soit catalase négative. Par exemple, les espèces Micrococcus et Staphylococcus sont positives et Streptococcus sont négatives. Des exemples d'autres étapes pour des groupes en dehors des non-cocci, non Gram positifs incluent la fermentation du lactose ou la non-fermentation pour les bâtonnets Gram négatifs.
Analysez les propriétés de fermentation des bactéries dans l'élément suivant de l'organigramme. La bactérie fermente ou s'oxyde. Staphylococcus aureus est fermentaire par opposition à Micrococcus, qui est oxydant.
L'analyse de fermentation est une étape courante pour l'identification des bactéries à Gram positif et à Gram négatif.
Ajoutez une autre ligne et forme à la organigramme. Cette étape représente un test de coagulation, un test biochimique appelé coagulase. Staphylococcus aureus produit l'enzyme coagulase et, lorsqu'il est testé avec un milieu approprié, se traduit par un caillot gélatineux. Tous les autres tests de staphylocoques comme coagulase négative.
D'autres étapes pour d'autres groupes de bactéries comprennent le test de l'oxydase pour les bâtonnets Gram négatifs, ou la fermentation rapide ou lente du lactose.
