Les nuages de Jupiter changent constamment et peuvent être vus dans une variété de couleurs, notamment le rouge, l'orange, le jaune et le blanc. Les couleurs des nuages sont causées par les différents produits chimiques présents dans l’atmosphère et par la manière dont la lumière du soleil se reflète sur les nuages.
Les nuages de Jupiter sont également responsables de la célèbre Grande Tache Rouge de la planète, une énorme tempête qui fait rage depuis au moins 300 ans. La grande tache rouge a à peu près la taille de la Terre et est si grande qu’elle peut être vue depuis la Terre avec un télescope.